Protein–RNA interactions for Protein: Q12527

ATG11, Autophagy-related protein 11, yeastyeast

Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG11Q12527 ELG1YOR144C 2376 nt2.11□□□□□ -2.07
ATG11Q12527 UBR2YLR024C 5619 nt2.11□□□□□ -2.07
ATG11Q12527 PET309YLR067C 2898 nt2.11□□□□□ -2.07
ATG11Q12527 NOC3YLR002C 1992 nt2.1□□□□□ -2.07
ATG11Q12527 PAU3YCR104W 375 nt2.1□□□□□ -2.07
ATG11Q12527 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt2.1□□□□□ -2.07
ATG11Q12527 PMP1YCR024C-A 123 nt2.09□□□□□ -2.07
ATG11Q12527 YBL053WYBL053W 375 nt2.09□□□□□ -2.07
ATG11Q12527 SAS3YBL052C 2496 nt2.09□□□□□ -2.08
ATG11Q12527 YLR419WYLR419W 4308 nt2.08□□□□□ -2.08
ATG11Q12527 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.08□□□□□ -2.08
ATG11Q12527 YGR164WYGR164W 336 nt2.08□□□□□ -2.08
ATG11Q12527 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt2.08□□□□□ -2.08
ATG11Q12527 RPL33BYOR234C 324 nt2.08□□□□□ -2.08
ATG11Q12527 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt2.08□□□□□ -2.08
ATG11Q12527 DCP2YNL118C 2913 nt2.08□□□□□ -2.08
ATG11Q12527 MAD1YGL086W 2250 nt2.07□□□□□ -2.08
ATG11Q12527 FAB1YFR019W 6837 nt2.06□□□□□ -2.08
ATG11Q12527 MSH5YDL154W 2706 nt2.06□□□□□ -2.08
ATG11Q12527 AHC1YOR023C 1701 nt2.06□□□□□ -2.08
ATG11Q12527 GCN2YDR283C 4980 nt2.06□□□□□ -2.08
ATG11Q12527 YDL118WYDL118W 381 nt2.06□□□□□ -2.08
ATG11Q12527 PEP1YBL017C 4740 nt2.06□□□□□ -2.08
ATG11Q12527 MYO2YOR326W 4725 nt2.06□□□□□ -2.08
ATG11Q12527 YLL007CYLL007C 1998 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG11Q12527 APL2YKL135C 2181 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG11Q12527 HIR3YJR140C 4947 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG11Q12527 TDA9YML081W 3756 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG11Q12527 SEC31YDL195W 3822 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG11Q12527 YDL196WYDL196W 330 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG11Q12527 YIR044CYIR044C 186 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG11Q12527 MAK10YEL053C 2202 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG11Q12527 CUL3YGR003W 2235 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG11Q12527 DGR2YKL121W 2559 nt2.04□□□□□ -2.08
ATG11Q12527 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.04□□□□□ -2.08
ATG11Q12527 COY1YKL179C 2040 nt2.03□□□□□ -2.08
ATG11Q12527 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt2.03□□□□□ -2.08
ATG11Q12527 BUD2YKL092C 3315 nt2.03□□□□□ -2.08
ATG11Q12527 MLH3YPL164C 2148 nt2.02□□□□□ -2.09
ATG11Q12527 CTR9YOL145C 3234 nt2.02□□□□□ -2.09
ATG11Q12527 HER1YOR227W 3741 nt2.02□□□□□ -2.09
ATG11Q12527 NEO1YIL048W 3456 nt2.01□□□□□ -2.09
ATG11Q12527 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt2.01□□□□□ -2.09
ATG11Q12527 YNL205CYNL205C 423 nt2.01□□□□□ -2.09
ATG11Q12527 PIG1YLR273C 1947 nt2□□□□□ -2.09
ATG11Q12527 YHR210CYHR210C 1026 nt2□□□□□ -2.09
ATG11Q12527 snR48snR48 113 nt2□□□□□ -2.09
ATG11Q12527 MDS3YGL197W 4464 nt1.99□□□□□ -2.09
ATG11Q12527 IRC20YLR247C 4671 nt1.99□□□□□ -2.09
ATG11Q12527 AGC1YPR021C 2709 nt1.99□□□□□ -2.09
ATG11Q12527 HMI1YOL095C 2121 nt1.99□□□□□ -2.09
ATG11Q12527 FIG4YNL325C 2640 nt1.99□□□□□ -2.09
ATG11Q12527 YEL073CYEL073C 324 nt1.99□□□□□ -2.09
ATG11Q12527 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.99□□□□□ -2.09
ATG11Q12527 AIM44YPL158C 2277 nt1.98□□□□□ -2.09
ATG11Q12527 IRE1YHR079C 3348 nt1.98□□□□□ -2.09
ATG11Q12527 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.98□□□□□ -2.09
ATG11Q12527 PIP2YOR363C 2991 nt1.98□□□□□ -2.09
ATG11Q12527 SEY1YOR165W 2331 nt1.98□□□□□ -2.09
ATG11Q12527 ATG9YDL149W 2994 nt1.98□□□□□ -2.09
ATG11Q12527 PRP42YDR235W 1635 nt1.97□□□□□ -2.09
ATG11Q12527 SEC63YOR254C 1992 nt1.96□□□□□ -2.1
ATG11Q12527 YBR206WYBR206W 324 nt1.96□□□□□ -2.1
ATG11Q12527 NCA2YPR155C 1851 nt1.96□□□□□ -2.1
ATG11Q12527 ALK1YGL021W 2283 nt1.96□□□□□ -2.1
ATG11Q12527 YDR521WYDR521W 336 nt1.95□□□□□ -2.1
ATG11Q12527 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.95□□□□□ -2.1
ATG11Q12527 YNL144CYNL144C 2223 nt1.95□□□□□ -2.1
ATG11Q12527 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.94□□□□□ -2.1
ATG11Q12527 PDR8YLR266C 2106 nt1.94□□□□□ -2.1
ATG11Q12527 MSH6YDR097C 3729 nt1.93□□□□□ -2.1
ATG11Q12527 PTP2YOR208W 2253 nt1.93□□□□□ -2.1
ATG11Q12527 TRM3YDL112W 4311 nt1.93□□□□□ -2.1
ATG11Q12527 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.93□□□□□ -2.1
ATG11Q12527 SFB2YNL049C 2631 nt1.92□□□□□ -2.1
ATG11Q12527 FRK1YPL141C 2598 nt1.92□□□□□ -2.1
ATG11Q12527 CTF4YPR135W 2784 nt1.92□□□□□ -2.1
ATG11Q12527 SLD3YGL113W 2007 nt1.92□□□□□ -2.1
ATG11Q12527 snR85snR85 171 nt1.92□□□□□ -2.1
ATG11Q12527 MYO4YAL029C 4416 nt1.92□□□□□ -2.1
ATG11Q12527 COG4YPR105C 2586 nt1.92□□□□□ -2.1
ATG11Q12527 MGA2YIR033W 3342 nt1.91□□□□□ -2.1
ATG11Q12527 PKH2YOL100W 3246 nt1.91□□□□□ -2.1
ATG11Q12527 HAL9YOL089C 3093 nt1.91□□□□□ -2.1
ATG11Q12527 RPS30BYOR182C 192 nt1.9□□□□□ -2.11
ATG11Q12527 IFH1YLR223C 3258 nt1.9□□□□□ -2.11
ATG11Q12527 PBY1YBR094W 2262 nt1.89□□□□□ -2.11
ATG11Q12527 NUP192YJL039C 5052 nt1.88□□□□□ -2.11
ATG11Q12527 YPL044CYPL044C 549 nt1.88□□□□□ -2.11
ATG11Q12527 YOR093CYOR093C 4947 nt1.88□□□□□ -2.11
ATG11Q12527 SLI15YBR156C 2097 nt1.87□□□□□ -2.11
ATG11Q12527 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.87□□□□□ -2.11
ATG11Q12527 TMA7YLR262C-A 195 nt1.87□□□□□ -2.11
ATG11Q12527 COA6YMR244C-A 315 nt1.86□□□□□ -2.11
ATG11Q12527 RTP1YMR185W 2946 nt1.86□□□□□ -2.11
ATG11Q12527 SBE22YHR103W 2559 nt1.86□□□□□ -2.11
ATG11Q12527 UTP21YLR409C 2820 nt1.85□□□□□ -2.11
ATG11Q12527 DNF3YMR162C 4971 nt1.85□□□□□ -2.11
ATG11Q12527 YJR039WYJR039W 3366 nt1.85□□□□□ -2.11
ATG11Q12527 MON2YNL297C 4911 nt1.84□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 48.8 ms