Protein–RNA interactions for Protein: Q12504

RKM4, Ribosomal lysine N-methyltransferase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RKM4Q12504 SDH6YDR379C-A 240 nt2.31□□□□□ -2.04
RKM4Q12504 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt2.31□□□□□ -2.04
RKM4Q12504 SAP185YJL098W 3177 nt2.31□□□□□ -2.04
RKM4Q12504 DGR2YKL121W 2559 nt2.31□□□□□ -2.04
RKM4Q12504 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt2.3□□□□□ -2.04
RKM4Q12504 RPL33BYOR234C 324 nt2.3□□□□□ -2.04
RKM4Q12504 HMI1YOL095C 2121 nt2.3□□□□□ -2.04
RKM4Q12504 GYP5YPL249C 2685 nt2.28□□□□□ -2.04
RKM4Q12504 IRC8YJL051W 2469 nt2.28□□□□□ -2.04
RKM4Q12504 CUL3YGR003W 2235 nt2.28□□□□□ -2.04
RKM4Q12504 YDL196WYDL196W 330 nt2.28□□□□□ -2.04
RKM4Q12504 PTP2YOR208W 2253 nt2.28□□□□□ -2.05
RKM4Q12504 IRE1YHR079C 3348 nt2.27□□□□□ -2.05
RKM4Q12504 BUD2YKL092C 3315 nt2.27□□□□□ -2.05
RKM4Q12504 HIR3YJR140C 4947 nt2.27□□□□□ -2.05
RKM4Q12504 NCA2YPR155C 1851 nt2.26□□□□□ -2.05
RKM4Q12504 AHC1YOR023C 1701 nt2.26□□□□□ -2.05
RKM4Q12504 YHR210CYHR210C 1026 nt2.26□□□□□ -2.05
RKM4Q12504 IST2YBR086C 2841 nt2.26□□□□□ -2.05
RKM4Q12504 PMP1YCR024C-A 123 nt2.25□□□□□ -2.05
RKM4Q12504 BRE1YDL074C 2103 nt2.25□□□□□ -2.05
RKM4Q12504 YGR164WYGR164W 336 nt2.25□□□□□ -2.05
RKM4Q12504 DGR1YNL130C-A 147 nt2.25□□□□□ -2.05
RKM4Q12504 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt2.25□□□□□ -2.05
RKM4Q12504 PIP2YOR363C 2991 nt2.25□□□□□ -2.05
RKM4Q12504 AIM44YPL158C 2277 nt2.24□□□□□ -2.05
RKM4Q12504 YEL073CYEL073C 324 nt2.24□□□□□ -2.05
RKM4Q12504 FIG4YNL325C 2640 nt2.23□□□□□ -2.05
RKM4Q12504 SIR4YDR227W 4077 nt2.23□□□□□ -2.05
RKM4Q12504 YDL118WYDL118W 381 nt2.23□□□□□ -2.05
RKM4Q12504 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.23□□□□□ -2.05
RKM4Q12504 COY1YKL179C 2040 nt2.23□□□□□ -2.05
RKM4Q12504 HSL1YKL101W 4557 nt2.23□□□□□ -2.05
RKM4Q12504 YDR521WYDR521W 336 nt2.22□□□□□ -2.05
RKM4Q12504 ALK1YGL021W 2283 nt2.22□□□□□ -2.05
RKM4Q12504 YNL144CYNL144C 2223 nt2.22□□□□□ -2.05
RKM4Q12504 FRK1YPL141C 2598 nt2.21□□□□□ -2.06
RKM4Q12504 YMR045CYMR045C 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
RKM4Q12504 Q0143Q0143 153 nt2.21□□□□□ -2.06
RKM4Q12504 SLD3YGL113W 2007 nt2.2□□□□□ -2.06
RKM4Q12504 IFH1YLR223C 3258 nt2.19□□□□□ -2.06
RKM4Q12504 HAL9YOL089C 3093 nt2.19□□□□□ -2.06
RKM4Q12504 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt2.18□□□□□ -2.06
RKM4Q12504 SEY1YOR165W 2331 nt2.18□□□□□ -2.06
RKM4Q12504 PBY1YBR094W 2262 nt2.18□□□□□ -2.06
RKM4Q12504 YBR206WYBR206W 324 nt2.18□□□□□ -2.06
RKM4Q12504 COG4YPR105C 2586 nt2.18□□□□□ -2.06
RKM4Q12504 PKH2YOL100W 3246 nt2.17□□□□□ -2.06
RKM4Q12504 YOR093CYOR093C 4947 nt2.17□□□□□ -2.06
RKM4Q12504 HER1YOR227W 3741 nt2.17□□□□□ -2.06
RKM4Q12504 SLI15YBR156C 2097 nt2.17□□□□□ -2.06
RKM4Q12504 SEC31YDL195W 3822 nt2.16□□□□□ -2.06
RKM4Q12504 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.16□□□□□ -2.06
RKM4Q12504 SEC63YOR254C 1992 nt2.16□□□□□ -2.06
RKM4Q12504 UBR2YLR024C 5619 nt2.15□□□□□ -2.06
RKM4Q12504 SFB2YNL049C 2631 nt2.15□□□□□ -2.07
RKM4Q12504 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.14□□□□□ -2.07
RKM4Q12504 TDA9YML081W 3756 nt2.14□□□□□ -2.07
RKM4Q12504 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt2.14□□□□□ -2.07
RKM4Q12504 NEO1YIL048W 3456 nt2.14□□□□□ -2.07
RKM4Q12504 SBE22YHR103W 2559 nt2.13□□□□□ -2.07
RKM4Q12504 ANS1YHR126C 480 nt2.13□□□□□ -2.07
RKM4Q12504 SPP41YDR464W 4308 nt2.13□□□□□ -2.07
RKM4Q12504 PRP42YDR235W 1635 nt2.13□□□□□ -2.07
RKM4Q12504 MSH6YDR097C 3729 nt2.12□□□□□ -2.07
RKM4Q12504 YBL053WYBL053W 375 nt2.12□□□□□ -2.07
RKM4Q12504 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt2.12□□□□□ -2.07
RKM4Q12504 PDR8YLR266C 2106 nt2.11□□□□□ -2.07
RKM4Q12504 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt2.11□□□□□ -2.07
RKM4Q12504 ATG9YDL149W 2994 nt2.1□□□□□ -2.07
RKM4Q12504 UBP2YOR124C 3819 nt2.1□□□□□ -2.07
RKM4Q12504 UTP21YLR409C 2820 nt2.1□□□□□ -2.07
RKM4Q12504 MYO4YAL029C 4416 nt2.1□□□□□ -2.07
RKM4Q12504 SPO24YPR036W-A 204 nt2.1□□□□□ -2.07
RKM4Q12504 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt2.09□□□□□ -2.07
RKM4Q12504 TMA7YLR262C-A 195 nt2.09□□□□□ -2.07
RKM4Q12504 FKS1YLR342W 5631 nt2.09□□□□□ -2.08
RKM4Q12504 FAB1YFR019W 6837 nt2.08□□□□□ -2.08
RKM4Q12504 SAC3YDR159W 3906 nt2.08□□□□□ -2.08
RKM4Q12504 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt2.08□□□□□ -2.08
RKM4Q12504 RPS30BYOR182C 192 nt2.08□□□□□ -2.08
RKM4Q12504 BPH1YCR032W 6504 nt2.08□□□□□ -2.08
RKM4Q12504 ADR1YDR216W 3972 nt2.07□□□□□ -2.08
RKM4Q12504 SNU13YEL026W 381 nt2.07□□□□□ -2.08
RKM4Q12504 YPL044CYPL044C 549 nt2.07□□□□□ -2.08
RKM4Q12504 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt2.07□□□□□ -2.08
RKM4Q12504 MDS3YGL197W 4464 nt2.07□□□□□ -2.08
RKM4Q12504 NUT1YGL151W 3399 nt2.06□□□□□ -2.08
RKM4Q12504 YLR419WYLR419W 4308 nt2.06□□□□□ -2.08
RKM4Q12504 MGA2YIR033W 3342 nt2.05□□□□□ -2.08
RKM4Q12504 PAA1YDR071C 576 nt2.05□□□□□ -2.08
RKM4Q12504 COX12YLR038C 252 nt2.05□□□□□ -2.08
RKM4Q12504 PEP1YBL017C 4740 nt2.04□□□□□ -2.08
RKM4Q12504 YNL205CYNL205C 423 nt2.04□□□□□ -2.08
RKM4Q12504 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.04□□□□□ -2.08
RKM4Q12504 IRC20YLR247C 4671 nt2.03□□□□□ -2.08
RKM4Q12504 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt2.03□□□□□ -2.08
RKM4Q12504 EMC5YIL027C 426 nt2.03□□□□□ -2.08
RKM4Q12504 snR48snR48 113 nt2.03□□□□□ -2.08
RKM4Q12504 YJR039WYJR039W 3366 nt2.03□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.2 ms