Protein–RNA interactions for Protein: Q08747

UAF30, Upstream activation factor subunit UAF30, yeastyeast

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UAF30Q08747 BIL1YOR304C-A 231 nt1.1□□□□□ -2.23
UAF30Q08747 WAR1YML076C 2835 nt1.1□□□□□ -2.23
UAF30Q08747 SIP4YJL089W 2490 nt1.09□□□□□ -2.23
UAF30Q08747 APL1YJR005W 2103 nt1.09□□□□□ -2.23
UAF30Q08747 ANS1YHR126C 480 nt1.09□□□□□ -2.23
UAF30Q08747 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt1.09□□□□□ -2.23
UAF30Q08747 PTP2YOR208W 2253 nt1.09□□□□□ -2.24
UAF30Q08747 SMC1YFL008W 3678 nt1.09□□□□□ -2.24
UAF30Q08747 YLL007CYLL007C 1998 nt1.08□□□□□ -2.24
UAF30Q08747 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.08□□□□□ -2.24
UAF30Q08747 YAR009CYAR009C 3591 nt1.08□□□□□ -2.24
UAF30Q08747 CDC39YCR093W 6327 nt1.08□□□□□ -2.24
UAF30Q08747 MDS3YGL197W 4464 nt1.07□□□□□ -2.24
UAF30Q08747 PAN2YGL094C 3348 nt1.07□□□□□ -2.24
UAF30Q08747 YGR130CYGR130C 2451 nt1.06□□□□□ -2.24
UAF30Q08747 NIP100YPL174C 2607 nt1.05□□□□□ -2.24
UAF30Q08747 NUP157YER105C 4176 nt1.05□□□□□ -2.24
UAF30Q08747 CSN9YDR179C 489 nt1.05□□□□□ -2.24
UAF30Q08747 RPL34BYIL052C 366 nt1.05□□□□□ -2.24
UAF30Q08747 ROM2YLR371W 4071 nt1.05□□□□□ -2.24
UAF30Q08747 VAM6YDL077C 3150 nt1.04□□□□□ -2.24
UAF30Q08747 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.04□□□□□ -2.24
UAF30Q08747 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.04□□□□□ -2.24
UAF30Q08747 NST1YNL091W 3723 nt1.04□□□□□ -2.24
UAF30Q08747 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt1.03□□□□□ -2.24
UAF30Q08747 YJR011CYJR011C 786 nt1.03□□□□□ -2.24
UAF30Q08747 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.02□□□□□ -2.25
UAF30Q08747 YAR029WYAR029W 225 nt1.02□□□□□ -2.25
UAF30Q08747 HTB2YBL002W 396 nt1.01□□□□□ -2.25
UAF30Q08747 YPR012WYPR012W 255 nt1.01□□□□□ -2.25
UAF30Q08747 GEA2YEL022W 4380 nt1.01□□□□□ -2.25
UAF30Q08747 YOR029WYOR029W 336 nt1□□□□□ -2.25
UAF30Q08747 YPR117WYPR117W 7470 nt0.99□□□□□ -2.25
UAF30Q08747 HMRA2YCR096C 360 nt0.99□□□□□ -2.25
UAF30Q08747 RPL35AYDL191W 363 nt0.99□□□□□ -2.25
UAF30Q08747 OST1YJL002C 1431 nt0.98□□□□□ -2.25
UAF30Q08747 YDR521WYDR521W 336 nt0.98□□□□□ -2.25
UAF30Q08747 TTI1YKL033W 3117 nt0.98□□□□□ -2.25
UAF30Q08747 YHL042WYHL042W 453 nt0.97□□□□□ -2.25
UAF30Q08747 YLR334CYLR334C 381 nt0.97□□□□□ -2.25
UAF30Q08747 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.96□□□□□ -2.26
UAF30Q08747 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.96□□□□□ -2.26
UAF30Q08747 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
UAF30Q08747 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.96□□□□□ -2.26
UAF30Q08747 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
UAF30Q08747 BEM2YER155C 6504 nt0.96□□□□□ -2.26
UAF30Q08747 YCK3YER123W 1575 nt0.96□□□□□ -2.26
UAF30Q08747 KAP120YPL125W 3099 nt0.95□□□□□ -2.26
UAF30Q08747 ISD11YER048W-A 285 nt0.95□□□□□ -2.26
UAF30Q08747 YJR029WYJR029W 5268 nt0.95□□□□□ -2.26
UAF30Q08747 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.95□□□□□ -2.26
UAF30Q08747 YDL196WYDL196W 330 nt0.94□□□□□ -2.26
UAF30Q08747 IES4YOR189W 351 nt0.94□□□□□ -2.26
UAF30Q08747 YBR206WYBR206W 324 nt0.94□□□□□ -2.26
UAF30Q08747 DBP6YNR038W 1890 nt0.94□□□□□ -2.26
UAF30Q08747 ALG13YGL047W 609 nt0.93□□□□□ -2.26
UAF30Q08747 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.93□□□□□ -2.26
UAF30Q08747 SCC2YDR180W 4482 nt0.92□□□□□ -2.26
UAF30Q08747 YDR048CYDR048C 315 nt0.92□□□□□ -2.26
UAF30Q08747 OLI1Q0130 231 nt0.92□□□□□ -2.26
UAF30Q08747 YOR282WYOR282W 321 nt0.92□□□□□ -2.26
UAF30Q08747 YBR064WYBR064W 429 nt0.92□□□□□ -2.26
UAF30Q08747 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.92□□□□□ -2.26
UAF30Q08747 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.91□□□□□ -2.26
UAF30Q08747 TAR1YLR154W-C 375 nt0.91□□□□□ -2.26
UAF30Q08747 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt0.91□□□□□ -2.26
UAF30Q08747 YPL044CYPL044C 549 nt0.91□□□□□ -2.26
UAF30Q08747 YPR197CYPR197C 564 nt0.91□□□□□ -2.26
UAF30Q08747 ECM12YHR021W-A 456 nt0.9□□□□□ -2.27
UAF30Q08747 SPO21YOL091W 1830 nt0.89□□□□□ -2.27
UAF30Q08747 YDR344CYDR344C 444 nt0.89□□□□□ -2.27
UAF30Q08747 RPS25BYLR333C 327 nt0.89□□□□□ -2.27
UAF30Q08747 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.89□□□□□ -2.27
UAF30Q08747 PAU24YBR301W 363 nt0.87□□□□□ -2.27
UAF30Q08747 PAA1YDR071C 576 nt0.86□□□□□ -2.27
UAF30Q08747 NOP9YJL010C 2001 nt0.84□□□□□ -2.27
UAF30Q08747 MCM10YIL150C 1716 nt0.84□□□□□ -2.27
UAF30Q08747 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.84□□□□□ -2.27
UAF30Q08747 YJL120WYJL120W 324 nt0.84□□□□□ -2.27
UAF30Q08747 CMC4YMR194C-B 222 nt0.84□□□□□ -2.27
UAF30Q08747 YMR321CYMR321C 318 nt0.84□□□□□ -2.27
UAF30Q08747 YAF9YNL107W 681 nt0.84□□□□□ -2.27
UAF30Q08747 DOP1YDR141C 5097 nt0.83□□□□□ -2.28
UAF30Q08747 PMP1YCR024C-A 123 nt0.82□□□□□ -2.28
UAF30Q08747 SSS1YDR086C 243 nt0.82□□□□□ -2.28
UAF30Q08747 BFR2YDR299W 1605 nt0.82□□□□□ -2.28
UAF30Q08747 UBP3YER151C 2739 nt0.81□□□□□ -2.28
UAF30Q08747 YPL225WYPL225W 441 nt0.81□□□□□ -2.28
UAF30Q08747 YDR102CYDR102C 333 nt0.8□□□□□ -2.28
UAF30Q08747 RPL26BYGR034W 384 nt0.8□□□□□ -2.28
UAF30Q08747 SGF11YPL047W 300 nt0.8□□□□□ -2.28
UAF30Q08747 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt0.79□□□□□ -2.28
UAF30Q08747 YOR218CYOR218C 420 nt0.79□□□□□ -2.28
UAF30Q08747 NHP2YDL208W 471 nt0.78□□□□□ -2.28
UAF30Q08747 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.78□□□□□ -2.28
UAF30Q08747 RKR1YMR247C 4689 nt0.78□□□□□ -2.28
UAF30Q08747 YNL211CYNL211C 261 nt0.78□□□□□ -2.28
UAF30Q08747 CSE2YNR010W 450 nt0.78□□□□□ -2.28
UAF30Q08747 HMRA1YCR097W 381 nt0.77□□□□□ -2.29
UAF30Q08747 GIM4YEL003W 336 nt0.77□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 89 ms