Protein–RNA interactions for Protein: Q01649

CIK1, Spindle pole body-associated protein CIK1, yeastyeast

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIK1Q01649 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.06□□□□□ -2.24
CIK1Q01649 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.06□□□□□ -2.24
CIK1Q01649 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.06□□□□□ -2.24
CIK1Q01649 PRP16YKR086W 3216 nt1.06□□□□□ -2.24
CIK1Q01649 WAR1YML076C 2835 nt1.05□□□□□ -2.24
CIK1Q01649 YHL042WYHL042W 453 nt1.05□□□□□ -2.24
CIK1Q01649 MAM33YIL070C 801 nt1.05□□□□□ -2.24
CIK1Q01649 LEE1YPL054W 906 nt1.05□□□□□ -2.24
CIK1Q01649 CUL3YGR003W 2235 nt1.04□□□□□ -2.24
CIK1Q01649 VAR1Q0140 1197 nt1.04□□□□□ -2.24
CIK1Q01649 SPO75YLL005C 2607 nt1.04□□□□□ -2.24
CIK1Q01649 SPT7YBR081C 3999 nt1.04□□□□□ -2.24
CIK1Q01649 STF2YGR008C 255 nt1.03□□□□□ -2.24
CIK1Q01649 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.03□□□□□ -2.24
CIK1Q01649 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.03□□□□□ -2.24
CIK1Q01649 YJR011CYJR011C 786 nt1.03□□□□□ -2.24
CIK1Q01649 HUG1YML058W-A 207 nt1.03□□□□□ -2.24
CIK1Q01649 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt1.03□□□□□ -2.24
CIK1Q01649 RIM20YOR275C 1986 nt1.02□□□□□ -2.25
CIK1Q01649 MYO1YHR023W 5787 nt1.01□□□□□ -2.25
CIK1Q01649 YDR426CYDR426C 378 nt1.01□□□□□ -2.25
CIK1Q01649 YER137W-AYER137W-A 306 nt1.01□□□□□ -2.25
CIK1Q01649 YOR121CYOR121C 306 nt1.01□□□□□ -2.25
CIK1Q01649 SCC2YDR180W 4482 nt1.01□□□□□ -2.25
CIK1Q01649 BEM2YER155C 6504 nt1.01□□□□□ -2.25
CIK1Q01649 YDL073WYDL073W 2955 nt1□□□□□ -2.25
CIK1Q01649 IML1YJR138W 4755 nt1□□□□□ -2.25
CIK1Q01649 YDL196WYDL196W 330 nt1□□□□□ -2.25
CIK1Q01649 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1□□□□□ -2.25
CIK1Q01649 YLL007CYLL007C 1998 nt0.99□□□□□ -2.25
CIK1Q01649 PCC1YKR095W-A 267 nt0.99□□□□□ -2.25
CIK1Q01649 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt0.99□□□□□ -2.25
CIK1Q01649 SIP4YJL089W 2490 nt0.98□□□□□ -2.25
CIK1Q01649 YDR521WYDR521W 336 nt0.98□□□□□ -2.25
CIK1Q01649 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt0.98□□□□□ -2.25
CIK1Q01649 PTP2YOR208W 2253 nt0.97□□□□□ -2.25
CIK1Q01649 SMC1YFL008W 3678 nt0.97□□□□□ -2.25
CIK1Q01649 DOP1YDR141C 5097 nt0.96□□□□□ -2.26
CIK1Q01649 ISD11YER048W-A 285 nt0.96□□□□□ -2.26
CIK1Q01649 CSN9YDR179C 489 nt0.95□□□□□ -2.26
CIK1Q01649 YBR206WYBR206W 324 nt0.95□□□□□ -2.26
CIK1Q01649 YBR064WYBR064W 429 nt0.94□□□□□ -2.26
CIK1Q01649 GEA2YEL022W 4380 nt0.93□□□□□ -2.26
CIK1Q01649 YPR117WYPR117W 7470 nt0.93□□□□□ -2.26
CIK1Q01649 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.92□□□□□ -2.26
CIK1Q01649 DBP6YNR038W 1890 nt0.91□□□□□ -2.26
CIK1Q01649 RKR1YMR247C 4689 nt0.91□□□□□ -2.26
CIK1Q01649 ALG13YGL047W 609 nt0.9□□□□□ -2.27
CIK1Q01649 YAR053WYAR053W 297 nt0.9□□□□□ -2.27
CIK1Q01649 YOR029WYOR029W 336 nt0.9□□□□□ -2.27
CIK1Q01649 YOR282WYOR282W 321 nt0.9□□□□□ -2.27
CIK1Q01649 YCK3YER123W 1575 nt0.88□□□□□ -2.27
CIK1Q01649 IES4YOR189W 351 nt0.88□□□□□ -2.27
CIK1Q01649 BFR2YDR299W 1605 nt0.87□□□□□ -2.27
CIK1Q01649 YDR157WYDR157W 402 nt0.87□□□□□ -2.27
CIK1Q01649 YLR334CYLR334C 381 nt0.87□□□□□ -2.27
CIK1Q01649 OST1YJL002C 1431 nt0.87□□□□□ -2.27
CIK1Q01649 HMRA2YCR096C 360 nt0.86□□□□□ -2.27
CIK1Q01649 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt0.86□□□□□ -2.27
CIK1Q01649 OLI1Q0130 231 nt0.86□□□□□ -2.27
CIK1Q01649 NOP9YJL010C 2001 nt0.86□□□□□ -2.27
CIK1Q01649 PMP1YCR024C-A 123 nt0.85□□□□□ -2.27
CIK1Q01649 MCM10YIL150C 1716 nt0.85□□□□□ -2.27
CIK1Q01649 YDR344CYDR344C 444 nt0.84□□□□□ -2.27
CIK1Q01649 YGR035CYGR035C 351 nt0.84□□□□□ -2.27
CIK1Q01649 YAR029WYAR029W 225 nt0.84□□□□□ -2.27
CIK1Q01649 RPL35AYDL191W 363 nt0.83□□□□□ -2.28
CIK1Q01649 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0.83□□□□□ -2.28
CIK1Q01649 HTB2YBL002W 396 nt0.83□□□□□ -2.28
CIK1Q01649 RPS30BYOR182C 192 nt0.83□□□□□ -2.28
CIK1Q01649 YPL044CYPL044C 549 nt0.83□□□□□ -2.28
CIK1Q01649 PAM16YJL104W 450 nt0.82□□□□□ -2.28
CIK1Q01649 CMC4YMR194C-B 222 nt0.82□□□□□ -2.28
CIK1Q01649 BIL1YOR304C-A 231 nt0.82□□□□□ -2.28
CIK1Q01649 PAU24YBR301W 363 nt0.82□□□□□ -2.28
CIK1Q01649 YJL120WYJL120W 324 nt0.81□□□□□ -2.28
CIK1Q01649 INA22YIR024C 651 nt0.8□□□□□ -2.28
CIK1Q01649 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.8□□□□□ -2.28
CIK1Q01649 YFL019CYFL019C 354 nt0.79□□□□□ -2.28
CIK1Q01649 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.79□□□□□ -2.28
CIK1Q01649 ECM12YHR021W-A 456 nt0.79□□□□□ -2.28
CIK1Q01649 RPS25BYLR333C 327 nt0.79□□□□□ -2.28
CIK1Q01649 ASE1YOR058C 2658 nt0.78□□□□□ -2.28
CIK1Q01649 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.78□□□□□ -2.28
CIK1Q01649 SPO21YOL091W 1830 nt0.78□□□□□ -2.29
CIK1Q01649 PAA1YDR071C 576 nt0.77□□□□□ -2.29
CIK1Q01649 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.77□□□□□ -2.29
CIK1Q01649 SEC1YDR164C 2175 nt0.77□□□□□ -2.29
CIK1Q01649 YPL225WYPL225W 441 nt0.76□□□□□ -2.29
CIK1Q01649 CHS6YJL099W 2241 nt0.75□□□□□ -2.29
CIK1Q01649 SSS1YDR086C 243 nt0.75□□□□□ -2.29
CIK1Q01649 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.75□□□□□ -2.29
CIK1Q01649 NPR2YEL062W 1848 nt0.74□□□□□ -2.29
CIK1Q01649 YNL211CYNL211C 261 nt0.74□□□□□ -2.29
CIK1Q01649 YDR048CYDR048C 315 nt0.73□□□□□ -2.29
CIK1Q01649 PAU12YGR294W 363 nt0.73□□□□□ -2.29
CIK1Q01649 TAR1YLR154W-C 375 nt0.73□□□□□ -2.29
CIK1Q01649 YAF9YNL107W 681 nt0.73□□□□□ -2.29
CIK1Q01649 RPL26BYGR034W 384 nt0.72□□□□□ -2.29
CIK1Q01649 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.72□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 49.8 ms