Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEST4Q8NFU0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms