Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1CQ15572 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
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