Protein–RNA interactions for Protein: Q12674

DNF3, Probable phospholipid-transporting ATPase DNF3, yeastyeast

Predictions only

Length 1,656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DNF3Q12674 YER158W-AYER158W-A 216 nt-0.4□□□□□ -2.47
DNF3Q12674 EMC4YGL231C 573 nt-0.4□□□□□ -2.47
DNF3Q12674 YNL211CYNL211C 261 nt-0.4□□□□□ -2.47
DNF3Q12674 AFB1YLR040C 675 nt-0.41□□□□□ -2.48
DNF3Q12674 BSC3YLR465C 309 nt-0.41□□□□□ -2.48
DNF3Q12674 CSM4YPL200W 471 nt-0.41□□□□□ -2.48
DNF3Q12674 SOV1YMR066W 2697 nt-0.42□□□□□ -2.48
DNF3Q12674 YDL187CYDL187C 330 nt-0.42□□□□□ -2.48
DNF3Q12674 NPC2YDL046W 522 nt-0.43□□□□□ -2.48
DNF3Q12674 LSO2YGR169C-A 279 nt-0.43□□□□□ -2.48
DNF3Q12674 COX5BYIL111W 456 nt-0.43□□□□□ -2.48
DNF3Q12674 GSP1YLR293C 660 nt-0.43□□□□□ -2.48
DNF3Q12674 YPL185WYPL185W 396 nt-0.43□□□□□ -2.48
DNF3Q12674 CUL3YGR003W 2235 nt-0.43□□□□□ -2.48
DNF3Q12674 snR8snR8 190 nt-0.43□□□□□ -2.48
DNF3Q12674 PRP21YJL203W 843 nt-0.43□□□□□ -2.48
DNF3Q12674 YJR011CYJR011C 786 nt-0.43□□□□□ -2.48
DNF3Q12674 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt-0.43□□□□□ -2.48
DNF3Q12674 LEE1YPL054W 906 nt-0.43□□□□□ -2.48
DNF3Q12674 ORC3YLL004W 1851 nt-0.43□□□□□ -2.48
DNF3Q12674 EFR3YMR212C 2349 nt-0.44□□□□□ -2.48
DNF3Q12674 MMS21YEL019C 804 nt-0.44□□□□□ -2.48
DNF3Q12674 POP6YGR030C 477 nt-0.45□□□□□ -2.48
DNF3Q12674 VPS63YLR261C 327 nt-0.45□□□□□ -2.48
DNF3Q12674 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt-0.45□□□□□ -2.48
DNF3Q12674 YDR008CYDR008C 351 nt-0.46□□□□□ -2.48
DNF3Q12674 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt-0.46□□□□□ -2.48
DNF3Q12674 YPR099CYPR099C 357 nt-0.46□□□□□ -2.48
DNF3Q12674 YLL032CYLL032C 2478 nt-0.47□□□□□ -2.48
DNF3Q12674 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt-0.47□□□□□ -2.48
DNF3Q12674 YPL044CYPL044C 549 nt-0.47□□□□□ -2.48
DNF3Q12674 ASE1YOR058C 2658 nt-0.48□□□□□ -2.49
DNF3Q12674 snR57snR57 88 nt-0.48□□□□□ -2.49
DNF3Q12674 RAD61YDR014W 1944 nt-0.48□□□□□ -2.49
DNF3Q12674 YER038W-AYER038W-A 381 nt-0.49□□□□□ -2.49
DNF3Q12674 RPS7BYNL096C 573 nt-0.49□□□□□ -2.49
DNF3Q12674 CDC33YOL139C 642 nt-0.49□□□□□ -2.49
DNF3Q12674 OLI1Q0130 231 nt-0.49□□□□□ -2.49
DNF3Q12674 TFB6YOR352W 1032 nt-0.49□□□□□ -2.49
DNF3Q12674 YBR206WYBR206W 324 nt-0.49□□□□□ -2.49
DNF3Q12674 SEC10YLR166C 2616 nt-0.5□□□□□ -2.49
DNF3Q12674 BI4Q0120 1917 nt-0.5□□□□□ -2.49
DNF3Q12674 RPS26AYGL189C 360 nt-0.5□□□□□ -2.49
DNF3Q12674 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt-0.5□□□□□ -2.49
DNF3Q12674 YLR271WYLR271W 825 nt-0.5□□□□□ -2.49
DNF3Q12674 YPL197CYPL197C 414 nt-0.5□□□□□ -2.49
DNF3Q12674 MAM33YIL070C 801 nt-0.51□□□□□ -2.49
DNF3Q12674 ECM9YKR004C 1134 nt-0.51□□□□□ -2.49
DNF3Q12674 SUS1YBR111W-A 291 nt-0.51□□□□□ -2.49
DNF3Q12674 snR79snR79 84 nt-0.52□□□□□ -2.49
DNF3Q12674 YDR344CYDR344C 444 nt-0.52□□□□□ -2.49
DNF3Q12674 YEL073CYEL073C 324 nt-0.52□□□□□ -2.49
DNF3Q12674 DAD1YDR016C 285 nt-0.53□□□□□ -2.49
DNF3Q12674 YDR210WYDR210W 228 nt-0.53□□□□□ -2.49
DNF3Q12674 DFG10YIL049W 762 nt-0.53□□□□□ -2.49
DNF3Q12674 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt-0.53□□□□□ -2.49
DNF3Q12674 OST4YDL232W 111 nt-0.53□□□□□ -2.49
DNF3Q12674 MRPL31YKL138C 396 nt-0.53□□□□□ -2.49
DNF3Q12674 YBR064WYBR064W 429 nt-0.53□□□□□ -2.49
DNF3Q12674 PAN3YKL025C 2040 nt-0.54□□□□□ -2.5
DNF3Q12674 HTB1YDR224C 396 nt-0.54□□□□□ -2.5
DNF3Q12674 YLR101CYLR101C 396 nt-0.54□□□□□ -2.5
DNF3Q12674 snR128snR128 126 nt-0.54□□□□□ -2.5
DNF3Q12674 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt-0.55□□□□□ -2.5
DNF3Q12674 NIP1YMR309C 2439 nt-0.55□□□□□ -2.5
DNF3Q12674 YKU70YMR284W 1809 nt-0.55□□□□□ -2.5
DNF3Q12674 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt-0.56□□□□□ -2.5
DNF3Q12674 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt-0.56□□□□□ -2.5
DNF3Q12674 YJR079WYJR079W 330 nt-0.56□□□□□ -2.5
DNF3Q12674 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt-0.56□□□□□ -2.5
DNF3Q12674 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt-0.56□□□□□ -2.5
DNF3Q12674 RFX1YLR176C 2436 nt-0.56□□□□□ -2.5
DNF3Q12674 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt-0.57□□□□□ -2.5
DNF3Q12674 PTP2YOR208W 2253 nt-0.57□□□□□ -2.5
DNF3Q12674 IRC2YDR112W 309 nt-0.57□□□□□ -2.5
DNF3Q12674 RUB1YDR139C 234 nt-0.58□□□□□ -2.5
DNF3Q12674 YFR057WYFR057W 456 nt-0.58□□□□□ -2.5
DNF3Q12674 snR59snR59 78 nt-0.59□□□□□ -2.5
DNF3Q12674 YGL204CYGL204C 306 nt-0.59□□□□□ -2.5
DNF3Q12674 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt-0.59□□□□□ -2.5
DNF3Q12674 GIM5YML094W 492 nt-0.59□□□□□ -2.5
DNF3Q12674 YOL160WYOL160W 342 nt-0.59□□□□□ -2.5
DNF3Q12674 ZIP2YGL249W 2115 nt-0.6□□□□□ -2.51
DNF3Q12674 YOL106WYOL106W 354 nt-0.6□□□□□ -2.51
DNF3Q12674 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt-0.61□□□□□ -2.51
DNF3Q12674 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt-0.61□□□□□ -2.51
DNF3Q12674 HTB2YBL002W 396 nt-0.61□□□□□ -2.51
DNF3Q12674 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt-0.61□□□□□ -2.51
DNF3Q12674 YNL146WYNL146W 303 nt-0.61□□□□□ -2.51
DNF3Q12674 RSM23YGL129C 1353 nt-0.61□□□□□ -2.51
DNF3Q12674 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt-0.62□□□□□ -2.51
DNF3Q12674 NFU1YKL040C 771 nt-0.62□□□□□ -2.51
DNF3Q12674 SDS22YKL193C 1017 nt-0.62□□□□□ -2.51
DNF3Q12674 snR44snR44 211 nt-0.62□□□□□ -2.51
DNF3Q12674 QCR7YDR529C 384 nt-0.63□□□□□ -2.51
DNF3Q12674 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.63□□□□□ -2.51
DNF3Q12674 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.63□□□□□ -2.51
DNF3Q12674 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.63□□□□□ -2.51
DNF3Q12674 UBS1YBR165W 834 nt-0.63□□□□□ -2.51
DNF3Q12674 PAA1YDR071C 576 nt-0.64□□□□□ -2.51
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