Protein–RNA interactions for Protein: Q12372

MMP1, S-methylmethionine permease 1, yeastyeast

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MMP1Q12372 SAP190YKR028W 3102 nt3.03□□□□□ -1.92
MMP1Q12372 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt3.03□□□□□ -1.92
MMP1Q12372 REC8YPR007C 2043 nt3.03□□□□□ -1.92
MMP1Q12372 SAP185YJL098W 3177 nt3.03□□□□□ -1.92
MMP1Q12372 MLH3YPL164C 2148 nt3.02□□□□□ -1.93
MMP1Q12372 CSR2YPR030W 3366 nt3.02□□□□□ -1.93
MMP1Q12372 AUS1YOR011W 4185 nt3.01□□□□□ -1.93
MMP1Q12372 CAF120YNL278W 3183 nt3.01□□□□□ -1.93
MMP1Q12372 STE6YKL209C 3873 nt3.01□□□□□ -1.93
MMP1Q12372 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.01□□□□□ -1.93
MMP1Q12372 AKR1YDR264C 2295 nt3.01□□□□□ -1.93
MMP1Q12372 MSH5YDL154W 2706 nt3.01□□□□□ -1.93
MMP1Q12372 TRS130YMR218C 3309 nt3.01□□□□□ -1.93
MMP1Q12372 YNL018CYNL018C 1839 nt3□□□□□ -1.93
MMP1Q12372 STU2YLR045C 2667 nt3□□□□□ -1.93
MMP1Q12372 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt3□□□□□ -1.93
MMP1Q12372 YNL144CYNL144C 2223 nt3□□□□□ -1.93
MMP1Q12372 GCN1YGL195W 8019 nt2.99□□□□□ -1.93
MMP1Q12372 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt2.98□□□□□ -1.93
MMP1Q12372 SRO77YBL106C 3033 nt2.98□□□□□ -1.93
MMP1Q12372 YEL025CYEL025C 3567 nt2.98□□□□□ -1.93
MMP1Q12372 NEW1YPL226W 3591 nt2.97□□□□□ -1.93
MMP1Q12372 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.97□□□□□ -1.93
MMP1Q12372 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.97□□□□□ -1.93
MMP1Q12372 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.97□□□□□ -1.93
MMP1Q12372 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.97□□□□□ -1.93
MMP1Q12372 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.97□□□□□ -1.93
MMP1Q12372 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.97□□□□□ -1.93
MMP1Q12372 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.97□□□□□ -1.93
MMP1Q12372 APL1YJR005W 2103 nt2.97□□□□□ -1.93
MMP1Q12372 SCP160YJL080C 3669 nt2.97□□□□□ -1.93
MMP1Q12372 STE11YLR362W 2154 nt2.96□□□□□ -1.94
MMP1Q12372 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.96□□□□□ -1.94
MMP1Q12372 YLL054CYLL054C 2532 nt2.96□□□□□ -1.94
MMP1Q12372 JSN1YJR091C 3276 nt2.96□□□□□ -1.94
MMP1Q12372 IRC8YJL051W 2469 nt2.96□□□□□ -1.94
MMP1Q12372 DYN2YDR424C 279 nt2.95□□□□□ -1.94
MMP1Q12372 YGL182CYGL182C 324 nt2.95□□□□□ -1.94
MMP1Q12372 RPS21AYKR057W 264 nt2.95□□□□□ -1.94
MMP1Q12372 BUD2YKL092C 3315 nt2.95□□□□□ -1.94
MMP1Q12372 HMI1YOL095C 2121 nt2.95□□□□□ -1.94
MMP1Q12372 ISW1YBR245C 3390 nt2.94□□□□□ -1.94
MMP1Q12372 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt2.94□□□□□ -1.94
MMP1Q12372 GEA1YJR031C 4227 nt2.94□□□□□ -1.94
MMP1Q12372 POL2YNL262W 6669 nt2.94□□□□□ -1.94
MMP1Q12372 NUP100YKL068W 2880 nt2.93□□□□□ -1.94
MMP1Q12372 DRS2YAL026C 4068 nt2.93□□□□□ -1.94
MMP1Q12372 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.92□□□□□ -1.94
MMP1Q12372 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.92□□□□□ -1.94
MMP1Q12372 UBP15YMR304W 3693 nt2.92□□□□□ -1.94
MMP1Q12372 PKH2YOL100W 3246 nt2.92□□□□□ -1.94
MMP1Q12372 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.91□□□□□ -1.94
MMP1Q12372 YJR039WYJR039W 3366 nt2.91□□□□□ -1.94
MMP1Q12372 POL3YDL102W 3294 nt2.91□□□□□ -1.94
MMP1Q12372 YLL020CYLL020C 306 nt2.9□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 NMD2YHR077C 3270 nt2.9□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 AGC1YPR021C 2709 nt2.9□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 YOR296WYOR296W 3870 nt2.89□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 COG4YPR105C 2586 nt2.89□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 PAU10YDR542W 363 nt2.89□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 PAU11YGL261C 363 nt2.89□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 LHS1YKL073W 2646 nt2.89□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 PAU4YLR461W 363 nt2.89□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 MLH1YMR167W 2310 nt2.89□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.89□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 YSP2YDR326C 4317 nt2.89□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 NAB6YML117W 3405 nt2.89□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 SLI15YBR156C 2097 nt2.88□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.88□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.88□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.88□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.88□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.88□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 ILS1YBL076C 3219 nt2.87□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 STB6YKL072W 2301 nt2.87□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 RAX2YLR084C 3663 nt2.87□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 snR45snR45 172 nt2.87□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 RIF1YBR275C 5751 nt2.87□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 RPA190YOR341W 4995 nt2.87□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 SSD1YDR293C 3753 nt2.87□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 CTR9YOL145C 3234 nt2.86□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 UBP1YDL122W 2430 nt2.86□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt2.86□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 YLR278CYLR278C 4026 nt2.85□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 TRM3YDL112W 4311 nt2.85□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 QCR9YGR183C 201 nt2.85□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 RPS29AYLR388W 171 nt2.85□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 SPO14YKR031C 5052 nt2.85□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 SNQ2YDR011W 4506 nt2.84□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 YDL206WYDL206W 2289 nt2.84□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.84□□□□□ -1.95
MMP1Q12372 UBR1YGR184C 5853 nt2.83□□□□□ -1.96
MMP1Q12372 FAR11YNL127W 2862 nt2.83□□□□□ -1.96
MMP1Q12372 RPL37BYDR500C 267 nt2.83□□□□□ -1.96
MMP1Q12372 TDA9YML081W 3756 nt2.83□□□□□ -1.96
MMP1Q12372 RCO1YMR075W 2055 nt2.83□□□□□ -1.96
MMP1Q12372 PRP8YHR165C 7242 nt2.82□□□□□ -1.96
MMP1Q12372 UTP8YGR128C 2142 nt2.82□□□□□ -1.96
MMP1Q12372 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt2.82□□□□□ -1.96
MMP1Q12372 TRL1YJL087C 2484 nt2.82□□□□□ -1.96
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