Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 YDR341CYDR341C 1824 nt1.96□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 MGA2YIR033W 3342 nt1.95□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 YJL150WYJL150W 303 nt1.95□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 YNL338WYNL338W 159 nt1.95□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 SNF5YBR289W 2718 nt1.95□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 SYH1YPL105C 2550 nt1.95□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 NAM7YMR080C 2916 nt1.94□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 RPH1YER169W 2391 nt1.94□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 PDE2YOR360C 1581 nt1.94□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 PET309YLR067C 2898 nt1.94□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 INP2YMR163C 2118 nt1.94□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 MNL2YLR057W 2550 nt1.94□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 SPT21YMR179W 2277 nt1.93□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 GYP5YPL249C 2685 nt1.93□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.93□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 UBP1YDL122W 2430 nt1.92□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.92□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 CHC1YGL206C 4962 nt1.92□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 VPS54YDR027C 2670 nt1.92□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.92□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.92□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 PAU18YLL064C 363 nt1.92□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 PAU6YNR076W 363 nt1.92□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 RPB10YOR210W 213 nt1.92□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 SEC31YDL195W 3822 nt1.92□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 MUK1YPL070W 1839 nt1.91□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 SWI5YDR146C 2130 nt1.91□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 UBP2YOR124C 3819 nt1.91□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 snR74snR74 88 nt1.91□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.91□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 TMA7YLR262C-A 195 nt1.91□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.91□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 YCL046WYCL046W 324 nt1.91□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 TRS65YGR166W 1683 nt1.9□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 PUT3YKL015W 2940 nt1.9□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 ELG1YOR144C 2376 nt1.9□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.9□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 YPR092WYPR092W 306 nt1.9□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 SLM1YIL105C 2061 nt1.9□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 RFX1YLR176C 2436 nt1.9□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 YCR043CYCR043C 384 nt1.89□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt1.89□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 YDL118WYDL118W 381 nt1.89□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 IRR1YIL026C 3453 nt1.89□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 LYS14YDR034C 2373 nt1.88□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 SWI6YLR182W 2412 nt1.88□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 SPC98YNL126W 2541 nt1.88□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.87□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 BPH1YCR032W 6504 nt1.87□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 NEO1YIL048W 3456 nt1.86□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 YEL014CYEL014C 306 nt1.86□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 OLI1Q0130 231 nt1.86□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt1.86□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 VPS55YJR044C 423 nt1.86□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 RRT15YLR162W-A 189 nt1.86□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt1.86□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 FKS1YLR342W 5631 nt1.86□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 UBR2YLR024C 5619 nt1.86□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 YMR045CYMR045C 5268 nt1.86□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 NIP100YPL174C 2607 nt1.86□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 YLR140WYLR140W 327 nt1.85□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 PRP39YML046W 1890 nt1.85□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 SEC5YDR166C 2916 nt1.85□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.84□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 ATP8Q0080 147 nt1.84□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 YGL217CYGL217C 342 nt1.84□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt1.84□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt1.84□□□□□ -2.11
UBX3Q12229 MYO4YAL029C 4416 nt1.84□□□□□ -2.12
UBX3Q12229 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.83□□□□□ -2.12
UBX3Q12229 ZRG8YER033C 3231 nt1.83□□□□□ -2.12
UBX3Q12229 HSH155YMR288W 2916 nt1.83□□□□□ -2.12
UBX3Q12229 SPO75YLL005C 2607 nt1.82□□□□□ -2.12
UBX3Q12229 SRP14YDL092W 441 nt1.82□□□□□ -2.12
UBX3Q12229 YOR376WYOR376W 369 nt1.82□□□□□ -2.12
UBX3Q12229 SGF11YPL047W 300 nt1.82□□□□□ -2.12
UBX3Q12229 GCN2YDR283C 4980 nt1.82□□□□□ -2.12
UBX3Q12229 YKU70YMR284W 1809 nt1.82□□□□□ -2.12
UBX3Q12229 SLY1YDR189W 2001 nt1.81□□□□□ -2.12
UBX3Q12229 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.81□□□□□ -2.12
UBX3Q12229 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.81□□□□□ -2.12
UBX3Q12229 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt1.81□□□□□ -2.12
UBX3Q12229 ZRG17YNR039C 1818 nt1.81□□□□□ -2.12
UBX3Q12229 RPS27BYHR021C 249 nt1.8□□□□□ -2.12
UBX3Q12229 SPO21YOL091W 1830 nt1.8□□□□□ -2.12
UBX3Q12229 YOR218CYOR218C 420 nt1.79□□□□□ -2.12
UBX3Q12229 SEC63YOR254C 1992 nt1.79□□□□□ -2.12
UBX3Q12229 YLR419WYLR419W 4308 nt1.78□□□□□ -2.12
UBX3Q12229 YJR039WYJR039W 3366 nt1.78□□□□□ -2.12
UBX3Q12229 RLM1YPL089C 2031 nt1.78□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 PAU3YCR104W 375 nt1.77□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 RPL34BYIL052C 366 nt1.77□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 SEY1YOR165W 2331 nt1.77□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 YNL144CYNL144C 2223 nt1.76□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 ENV11YGR071C 2583 nt1.76□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.76□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 YOR170WYOR170W 306 nt1.76□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 snR46snR46 197 nt1.76□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 MSC6YOR354C 2079 nt1.76□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 TFC8YPL007C 1767 nt1.75□□□□□ -2.13
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