Protein–RNA interactions for Protein: Q12196

RIO1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIO1Q12196 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.73□□□□□ -2.29
RIO1Q12196 YHR130CYHR130C 336 nt0.73□□□□□ -2.29
RIO1Q12196 YBL071CYBL071C 309 nt0.73□□□□□ -2.29
RIO1Q12196 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.73□□□□□ -2.29
RIO1Q12196 PIG1YLR273C 1947 nt0.73□□□□□ -2.29
RIO1Q12196 MPT5YGL178W 2580 nt0.73□□□□□ -2.29
RIO1Q12196 CBS1YDL069C 690 nt0.72□□□□□ -2.29
RIO1Q12196 MRPL31YKL138C 396 nt0.72□□□□□ -2.29
RIO1Q12196 YLR171WYLR171W 390 nt0.72□□□□□ -2.29
RIO1Q12196 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt0.72□□□□□ -2.29
RIO1Q12196 NUP157YER105C 4176 nt0.71□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 YHR125WYHR125W 306 nt0.71□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.71□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 HIT1YJR055W 495 nt0.71□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 YLR101CYLR101C 396 nt0.71□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.71□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.71□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.71□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 YLL032CYLL032C 2478 nt0.71□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 YHL041WYHL041W 450 nt0.7□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.7□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 YLR287CYLR287C 1068 nt0.7□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 YBR012CYBR012C 420 nt0.7□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 snR54snR54 86 nt0.7□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 SCW11YGL028C 1629 nt0.69□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.69□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 YJL135WYJL135W 318 nt0.69□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 RPL26AYLR344W 384 nt0.69□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 YLR456WYLR456W 615 nt0.69□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.69□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 SET3YKR029C 2256 nt0.69□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 ENV11YGR071C 2583 nt0.69□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 RFX1YLR176C 2436 nt0.68□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 UPS1YLR193C 528 nt0.68□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.68□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 RKR1YMR247C 4689 nt0.68□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 GEA2YEL022W 4380 nt0.67□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 snR72snR72 98 nt0.67□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 YDR114CYDR114C 303 nt0.67□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 YDR269CYDR269C 324 nt0.67□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 ECL1YGR146C 636 nt0.67□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 TIM13YGR181W 318 nt0.67□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 PAM16YJL104W 450 nt0.67□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.67□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 FIG4YNL325C 2640 nt0.67□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 AIM44YPL158C 2277 nt0.66□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 YDL011CYDL011C 324 nt0.66□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 YAP6YDR259C 1152 nt0.66□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.66□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.66□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 YJR157WYJR157W 363 nt0.66□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.66□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 STO1YMR125W 2586 nt0.66□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 SWI6YLR182W 2412 nt0.66□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 YDL206WYDL206W 2289 nt0.66□□□□□ -2.3
RIO1Q12196 YGR042WYGR042W 816 nt0.65□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 YPL182CYPL182C 384 nt0.65□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 APL2YKL135C 2181 nt0.64□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 SDH7YDR511W 402 nt0.64□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 YIL059CYIL059C 366 nt0.64□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 YLR202CYLR202C 327 nt0.64□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 RPB10YOR210W 213 nt0.64□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 RIM20YOR275C 1986 nt0.63□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 PCF11YDR228C 1881 nt0.63□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 DIE2YGR227W 1578 nt0.63□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 EFR3YMR212C 2349 nt0.63□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 LCD1YDR499W 2244 nt0.63□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 ISF1YMR081C 1017 nt0.63□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 NPC2YDL046W 522 nt0.62□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 YDL196WYDL196W 330 nt0.62□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 YKL083WYKL083W 615 nt0.62□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 RPS27AYKL156W 249 nt0.62□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 RRT1YBL048W 312 nt0.62□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 MRPL50YNR022C 420 nt0.62□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 YOR199WYOR199W 330 nt0.62□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 snR51snR51 107 nt0.62□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 PAC1YOR269W 1485 nt0.61□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 ZIP2YGL249W 2115 nt0.61□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 YAR047CYAR047C 321 nt0.61□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 YLR434CYLR434C 384 nt0.61□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 YJR003CYJR003C 1560 nt0.61□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 SLY1YDR189W 2001 nt0.6□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 COG4YPR105C 2586 nt0.6□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 SWF1YDR126W 1011 nt0.6□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 PDE2YOR360C 1581 nt0.6□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 YML002WYML002W 2214 nt0.59□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 Q0144Q0144 330 nt0.59□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 RPS24BYIL069C 408 nt0.59□□□□□ -2.31
RIO1Q12196 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.59□□□□□ -2.31
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