Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 BST1YFL025C 3090 nt1.58□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 SXM1YDR395W 2835 nt1.58□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 ENV11YGR071C 2583 nt1.58□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 YDR426CYDR426C 378 nt1.57□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 YGL217CYGL217C 342 nt1.57□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 PCC1YKR095W-A 267 nt1.57□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.57□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 TIM18YOR297C 579 nt1.57□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.57□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 SBE22YHR103W 2559 nt1.57□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 YBP1YBR216C 2025 nt1.57□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 RPL35AYDL191W 363 nt1.56□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 YLR255CYLR255C 354 nt1.56□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.56□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 KCS1YDR017C 3153 nt1.55□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 YLL054CYLL054C 2532 nt1.55□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt1.55□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt1.55□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 YAF9YNL107W 681 nt1.55□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 SLX4YLR135W 2247 nt1.55□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 PMD1YER132C 5262 nt1.55□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 IRA1YBR140C 9279 nt1.54□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.54□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 NPC2YDL046W 522 nt1.54□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 COA6YMR244C-A 315 nt1.54□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 YOL160WYOL160W 342 nt1.54□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 KIP1YBL063W 3336 nt1.54□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 SCW11YGL028C 1629 nt1.53□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 VPS55YJR044C 423 nt1.53□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 MAD1YGL086W 2250 nt1.52□□□□□ -2.17
NMD4Q12129 VPS54YDR027C 2670 nt1.52□□□□□ -2.17
NMD4Q12129 BRR2YER172C 6492 nt1.52□□□□□ -2.17
NMD4Q12129 HTB2YBL002W 396 nt1.52□□□□□ -2.17
NMD4Q12129 NUP192YJL039C 5052 nt1.5□□□□□ -2.17
NMD4Q12129 CAT8YMR280C 4302 nt1.5□□□□□ -2.17
NMD4Q12129 Q0142Q0142 177 nt1.5□□□□□ -2.17
NMD4Q12129 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.5□□□□□ -2.17
NMD4Q12129 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.5□□□□□ -2.17
NMD4Q12129 POL5YEL055C 3069 nt1.5□□□□□ -2.17
NMD4Q12129 KAP122YGL016W 3246 nt1.49□□□□□ -2.17
NMD4Q12129 SPC110YDR356W 2835 nt1.49□□□□□ -2.17
NMD4Q12129 YJL015CYJL015C 285 nt1.49□□□□□ -2.17
NMD4Q12129 SLI15YBR156C 2097 nt1.49□□□□□ -2.17
NMD4Q12129 YDR102CYDR102C 333 nt1.48□□□□□ -2.17
NMD4Q12129 YAR029WYAR029W 225 nt1.48□□□□□ -2.17
NMD4Q12129 RAD34YDR314C 2079 nt1.47□□□□□ -2.17
NMD4Q12129 NUT1YGL151W 3399 nt1.47□□□□□ -2.17
NMD4Q12129 YIL102CYIL102C 306 nt1.47□□□□□ -2.17
NMD4Q12129 snR14snR14 160 nt1.47□□□□□ -2.17
NMD4Q12129 YBR174CYBR174C 315 nt1.47□□□□□ -2.17
NMD4Q12129 AZF1YOR113W 2745 nt1.47□□□□□ -2.17
NMD4Q12129 AIM44YPL158C 2277 nt1.47□□□□□ -2.17
NMD4Q12129 YDR048CYDR048C 315 nt1.46□□□□□ -2.18
NMD4Q12129 MAM33YIL070C 801 nt1.46□□□□□ -2.18
NMD4Q12129 TAR1YLR154W-C 375 nt1.46□□□□□ -2.18
NMD4Q12129 YPL225WYPL225W 441 nt1.46□□□□□ -2.18
NMD4Q12129 EST2YLR318W 2655 nt1.46□□□□□ -2.18
NMD4Q12129 LCD1YDR499W 2244 nt1.46□□□□□ -2.18
NMD4Q12129 MPT5YGL178W 2580 nt1.45□□□□□ -2.18
NMD4Q12129 YDL211CYDL211C 1119 nt1.45□□□□□ -2.18
NMD4Q12129 COG4YPR105C 2586 nt1.45□□□□□ -2.18
NMD4Q12129 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.44□□□□□ -2.18
NMD4Q12129 YKL136WYKL136W 399 nt1.44□□□□□ -2.18
NMD4Q12129 YSY6YBR162W-A 198 nt1.44□□□□□ -2.18
NMD4Q12129 snR36snR36 182 nt1.43□□□□□ -2.18
NMD4Q12129 SPC98YNL126W 2541 nt1.43□□□□□ -2.18
NMD4Q12129 SPT21YMR179W 2277 nt1.42□□□□□ -2.18
NMD4Q12129 CUL3YGR003W 2235 nt1.42□□□□□ -2.18
NMD4Q12129 YIR044CYIR044C 186 nt1.42□□□□□ -2.18
NMD4Q12129 PFD1YJL179W 330 nt1.42□□□□□ -2.18
NMD4Q12129 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.42□□□□□ -2.18
NMD4Q12129 PKH2YOL100W 3246 nt1.42□□□□□ -2.18
NMD4Q12129 PIP2YOR363C 2991 nt1.42□□□□□ -2.18
NMD4Q12129 NIP100YPL174C 2607 nt1.42□□□□□ -2.18
NMD4Q12129 CHS1YNL192W 3396 nt1.42□□□□□ -2.18
NMD4Q12129 YKL118WYKL118W 312 nt1.41□□□□□ -2.18
NMD4Q12129 CDC31YOR257W 486 nt1.41□□□□□ -2.18
NMD4Q12129 PET127YOR017W 2403 nt1.41□□□□□ -2.18
NMD4Q12129 FIG4YNL325C 2640 nt1.4□□□□□ -2.18
NMD4Q12129 FIG2YCR089W 4830 nt1.4□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 NHP2YDL208W 471 nt1.4□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 CCH1YGR217W 6120 nt1.4□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 NUP188YML103C 4968 nt1.4□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 MMS4YBR098W 2076 nt1.39□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 MSH3YCR092C 3057 nt1.39□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 PIK1YNL267W 3201 nt1.39□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 RPL34BYIL052C 366 nt1.39□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.39□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 OST1YJL002C 1431 nt1.39□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 YDR413CYDR413C 576 nt1.38□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 YFL032WYFL032W 321 nt1.38□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.38□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 YJR011CYJR011C 786 nt1.38□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 SWI4YER111C 3282 nt1.38□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 HKR1YDR420W 5409 nt1.37□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt1.37□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 GPG1YGL121C 381 nt1.37□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 YLL020CYLL020C 306 nt1.37□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 YDL206WYDL206W 2289 nt1.37□□□□□ -2.19
NMD4Q12129 PTP2YOR208W 2253 nt1.37□□□□□ -2.19
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