Protein–RNA interactions for Protein: Q08873

SCP1, Transgelin, yeastyeast

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SCP1Q08873 NPC2YDL046W 522 nt-0.62□□□□□ -2.51
SCP1Q08873 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt-0.62□□□□□ -2.51
SCP1Q08873 RUF20RUF20 443 nt-0.62□□□□□ -2.51
SCP1Q08873 LEE1YPL054W 906 nt-0.62□□□□□ -2.51
SCP1Q08873 UTP8YGR128C 2142 nt-0.62□□□□□ -2.51
SCP1Q08873 OST4YDL232W 111 nt-0.65□□□□□ -2.51
SCP1Q08873 YEL010WYEL010W 351 nt-0.65□□□□□ -2.51
SCP1Q08873 LSM4YER112W 564 nt-0.65□□□□□ -2.51
SCP1Q08873 RPS26AYGL189C 360 nt-0.65□□□□□ -2.51
SCP1Q08873 MYO1YHR023W 5787 nt-0.66□□□□□ -2.51
SCP1Q08873 MMS21YEL019C 804 nt-0.66□□□□□ -2.52
SCP1Q08873 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt-0.66□□□□□ -2.52
SCP1Q08873 RPS10BYMR230W 318 nt-0.66□□□□□ -2.52
SCP1Q08873 YLL032CYLL032C 2478 nt-0.66□□□□□ -2.52
SCP1Q08873 THG1YGR024C 714 nt-0.67□□□□□ -2.52
SCP1Q08873 YJL086CYJL086C 369 nt-0.67□□□□□ -2.52
SCP1Q08873 snR128snR128 126 nt-0.67□□□□□ -2.52
SCP1Q08873 ATP20YPR020W 348 nt-0.68□□□□□ -2.52
SCP1Q08873 NFU1YKL040C 771 nt-0.69□□□□□ -2.52
SCP1Q08873 AFB1YLR040C 675 nt-0.69□□□□□ -2.52
SCP1Q08873 YNL146WYNL146W 303 nt-0.69□□□□□ -2.52
SCP1Q08873 snR79snR79 84 nt-0.7□□□□□ -2.52
SCP1Q08873 YDR008CYDR008C 351 nt-0.7□□□□□ -2.52
SCP1Q08873 MAM33YIL070C 801 nt-0.7□□□□□ -2.52
SCP1Q08873 COX5BYIL111W 456 nt-0.7□□□□□ -2.52
SCP1Q08873 PRP21YJL203W 843 nt-0.7□□□□□ -2.52
SCP1Q08873 GIM5YML094W 492 nt-0.7□□□□□ -2.52
SCP1Q08873 YNL211CYNL211C 261 nt-0.7□□□□□ -2.52
SCP1Q08873 TFB6YOR352W 1032 nt-0.71□□□□□ -2.52
SCP1Q08873 SVS1YPL163C 783 nt-0.71□□□□□ -2.52
SCP1Q08873 PAN3YKL025C 2040 nt-0.71□□□□□ -2.52
SCP1Q08873 YKU70YMR284W 1809 nt-0.72□□□□□ -2.52
SCP1Q08873 MRPL31YKL138C 396 nt-0.72□□□□□ -2.52
SCP1Q08873 ECM9YKR004C 1134 nt-0.72□□□□□ -2.52
SCP1Q08873 YNL171CYNL171C 369 nt-0.72□□□□□ -2.52
SCP1Q08873 COY1YKL179C 2040 nt-0.72□□□□□ -2.53
SCP1Q08873 OLI1Q0130 231 nt-0.73□□□□□ -2.53
SCP1Q08873 POP6YGR030C 477 nt-0.73□□□□□ -2.53
SCP1Q08873 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt-0.73□□□□□ -2.53
SCP1Q08873 snR57snR57 88 nt-0.74□□□□□ -2.53
SCP1Q08873 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt-0.74□□□□□ -2.53
SCP1Q08873 YJR079WYJR079W 330 nt-0.74□□□□□ -2.53
SCP1Q08873 CMS1YLR003C 876 nt-0.74□□□□□ -2.53
SCP1Q08873 YPR099CYPR099C 357 nt-0.74□□□□□ -2.53
SCP1Q08873 VPS63YLR261C 327 nt-0.75□□□□□ -2.53
SCP1Q08873 GLG1YKR058W 1851 nt-0.75□□□□□ -2.53
SCP1Q08873 NIP100YPL174C 2607 nt-0.76□□□□□ -2.53
SCP1Q08873 HAL9YOL089C 3093 nt-0.76□□□□□ -2.53
SCP1Q08873 QCR7YDR529C 384 nt-0.76□□□□□ -2.53
SCP1Q08873 BI4Q0120 1917 nt-0.76□□□□□ -2.53
SCP1Q08873 MCM10YIL150C 1716 nt-0.77□□□□□ -2.53
SCP1Q08873 YCR022CYCR022C 345 nt-0.77□□□□□ -2.53
SCP1Q08873 TDA2YER071C 381 nt-0.77□□□□□ -2.53
SCP1Q08873 YER076W-AYER076W-A 348 nt-0.77□□□□□ -2.53
SCP1Q08873 YJL007CYJL007C 315 nt-0.77□□□□□ -2.53
SCP1Q08873 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt-0.77□□□□□ -2.53
SCP1Q08873 COX7YMR256C 183 nt-0.77□□□□□ -2.53
SCP1Q08873 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt-0.77□□□□□ -2.53
SCP1Q08873 YER038W-AYER038W-A 381 nt-0.78□□□□□ -2.53
SCP1Q08873 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt-0.78□□□□□ -2.53
SCP1Q08873 YPL185WYPL185W 396 nt-0.78□□□□□ -2.53
SCP1Q08873 NNF2YGR089W 2811 nt-0.79□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt-0.79□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 HTB2YBL002W 396 nt-0.79□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 ZIP2YGL249W 2115 nt-0.8□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 RFX1YLR176C 2436 nt-0.8□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 RPM2YML091C 3609 nt-0.81□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 ASE1YOR058C 2658 nt-0.81□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 PTP2YOR208W 2253 nt-0.81□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 YER158W-AYER158W-A 216 nt-0.81□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt-0.82□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.82□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.82□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.82□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt-0.82□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 YLR198CYLR198C 360 nt-0.82□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt-0.82□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 YBR206WYBR206W 324 nt-0.82□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 NIP1YMR309C 2439 nt-0.83□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 DIE2YGR227W 1578 nt-0.83□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 RUB1YDR139C 234 nt-0.83□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt-0.83□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 YBR064WYBR064W 429 nt-0.83□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 SUS1YBR111W-A 291 nt-0.83□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt-0.83□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.84□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt-0.84□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 HTB1YDR224C 396 nt-0.84□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 YER138W-AYER138W-A 105 nt-0.84□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt-0.84□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 BLS1YLR408C 369 nt-0.84□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 YOR345CYOR345C 351 nt-0.84□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 snR44snR44 211 nt-0.84□□□□□ -2.54
SCP1Q08873 RMD6YEL072W 696 nt-0.85□□□□□ -2.55
SCP1Q08873 DFG10YIL049W 762 nt-0.85□□□□□ -2.55
SCP1Q08873 SDS22YKL193C 1017 nt-0.85□□□□□ -2.55
SCP1Q08873 GSP1YLR293C 660 nt-0.85□□□□□ -2.55
SCP1Q08873 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt-0.85□□□□□ -2.55
SCP1Q08873 PAA1YDR071C 576 nt-0.87□□□□□ -2.55
SCP1Q08873 YPL205CYPL205C 345 nt-0.87□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.8 ms