Protein–RNA interactions for Protein: Q06410

ATG17, Autophagy-related protein 17, yeastyeast

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG17Q06410 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG17Q06410 FIG4YNL325C 2640 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG17Q06410 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG17Q06410 LCD1YDR499W 2244 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG17Q06410 AIM44YPL158C 2277 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG17Q06410 YPR117WYPR117W 7470 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG17Q06410 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt0.81□□□□□ -2.28
ATG17Q06410 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.81□□□□□ -2.28
ATG17Q06410 YOR199WYOR199W 330 nt0.81□□□□□ -2.28
ATG17Q06410 PDE2YOR360C 1581 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG17Q06410 WIP1YDR374W-A 270 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG17Q06410 YDL073WYDL073W 2955 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG17Q06410 NPC2YDL046W 522 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG17Q06410 YHR125WYHR125W 306 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG17Q06410 YHR130CYHR130C 336 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG17Q06410 EFR3YMR212C 2349 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG17Q06410 MMS4YBR098W 2076 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG17Q06410 TIM13YGR181W 318 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG17Q06410 YGR290WYGR290W 444 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG17Q06410 RPS27AYKL156W 249 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG17Q06410 ZEO1YOL109W 342 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG17Q06410 SLI15YBR156C 2097 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG17Q06410 YDL206WYDL206W 2289 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG17Q06410 BI2Q0110 1272 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG17Q06410 YBL071CYBL071C 309 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG17Q06410 YNL122CYNL122C 348 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG17Q06410 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG17Q06410 ZIP2YGL249W 2115 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG17Q06410 COG4YPR105C 2586 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG17Q06410 YJR003CYJR003C 1560 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG17Q06410 YDL196WYDL196W 330 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG17Q06410 RTT102YGR275W 474 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG17Q06410 FYV7YLR068W 456 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG17Q06410 YDL011CYDL011C 324 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG17Q06410 YGR042WYGR042W 816 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG17Q06410 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG17Q06410 YKL202WYKL202W 582 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG17Q06410 PRP16YKR086W 3216 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG17Q06410 YJL135WYJL135W 318 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG17Q06410 snR54snR54 86 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG17Q06410 RIM20YOR275C 1986 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG17Q06410 RKR1YMR247C 4689 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG17Q06410 SEC1YDR164C 2175 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG17Q06410 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG17Q06410 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG17Q06410 YLR287CYLR287C 1068 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG17Q06410 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG17Q06410 RPB10YOR210W 213 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG17Q06410 YAR009CYAR009C 3591 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG17Q06410 WAR1YML076C 2835 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG17Q06410 SWF1YDR126W 1011 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG17Q06410 YLR171WYLR171W 390 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG17Q06410 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG17Q06410 YOL160WYOL160W 342 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG17Q06410 PAN2YGL094C 3348 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG17Q06410 snR189snR189 189 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG17Q06410 DIE2YGR227W 1578 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG17Q06410 snR72snR72 98 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG17Q06410 NHP2YDL208W 471 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG17Q06410 UBC7YMR022W 498 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG17Q06410 TOM22YNL131W 459 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG17Q06410 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG17Q06410 LOA1YPR139C 903 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG17Q06410 CBS1YDL069C 690 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG17Q06410 GPG1YGL121C 381 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG17Q06410 ECL1YGR146C 636 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG17Q06410 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG17Q06410 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG17Q06410 snR51snR51 107 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG17Q06410 YPL261CYPL261C 309 nt0.67□□□□□ -2.3
ATG17Q06410 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.67□□□□□ -2.3
ATG17Q06410 PAC1YOR269W 1485 nt0.67□□□□□ -2.3
ATG17Q06410 SDH7YDR511W 402 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG17Q06410 YDR521WYDR521W 336 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG17Q06410 YHL042WYHL042W 453 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG17Q06410 YLR101CYLR101C 396 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG17Q06410 GEA2YEL022W 4380 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG17Q06410 RAD34YDR314C 2079 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG17Q06410 PKH2YOL100W 3246 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG17Q06410 YHL041WYHL041W 450 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG17Q06410 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG17Q06410 YPL229WYPL229W 621 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG17Q06410 snR41snR41 95 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG17Q06410 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.64□□□□□ -2.31
ATG17Q06410 ISD11YER048W-A 285 nt0.64□□□□□ -2.31
ATG17Q06410 ALG13YGL047W 609 nt0.64□□□□□ -2.31
ATG17Q06410 YNL303WYNL303W 348 nt0.64□□□□□ -2.31
ATG17Q06410 IES4YOR189W 351 nt0.64□□□□□ -2.31
ATG17Q06410 DBP6YNR038W 1890 nt0.64□□□□□ -2.31
ATG17Q06410 BFR2YDR299W 1605 nt0.64□□□□□ -2.31
ATG17Q06410 YAP6YDR259C 1152 nt0.63□□□□□ -2.31
ATG17Q06410 CMC4YMR194C-B 222 nt0.63□□□□□ -2.31
ATG17Q06410 RPL26AYLR344W 384 nt0.62□□□□□ -2.31
ATG17Q06410 PAM16YJL104W 450 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG17Q06410 YKL083WYKL083W 615 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG17Q06410 MRPL50YNR022C 420 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG17Q06410 INP2YMR163C 2118 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG17Q06410 ATP19YOL077W-A 207 nt0.6□□□□□ -2.31
ATG17Q06410 YAR047CYAR047C 321 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG17Q06410 ISF1YMR081C 1017 nt0.59□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.1 ms