Protein–RNA interactions for Protein: Q02209

YKR011C, Uncharacterized protein YKR011C, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR011CQ02209 MLH1YMR167W 2310 nt2.26□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 SPO21YOL091W 1830 nt2.26□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 HSH155YMR288W 2916 nt2.26□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 ZIP2YGL249W 2115 nt2.26□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt2.26□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 YBR174CYBR174C 315 nt2.26□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 GIP3YPL137C 3831 nt2.26□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 TRL1YJL087C 2484 nt2.26□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.25□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 RAV1YJR033C 4074 nt2.25□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 YDR341CYDR341C 1824 nt2.25□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 NAM7YMR080C 2916 nt2.25□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 RAD34YDR314C 2079 nt2.25□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 PDR11YIL013C 4236 nt2.25□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 MAK10YEL053C 2202 nt2.25□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 ORC2YBR060C 1863 nt2.24□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 VPS13YLL040C 9435 nt2.24□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 YJL120WYJL120W 324 nt2.24□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 ATP7YKL016C 525 nt2.24□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 RPS25BYLR333C 327 nt2.24□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 snR52snR52 92 nt2.24□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 ENV11YGR071C 2583 nt2.24□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 CAT2YML042W 2013 nt2.24□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 ATG11YPR049C 3537 nt2.23□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 BRP1YGL007W 378 nt2.23□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt2.23□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 CDC60YPL160W 3273 nt2.22□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.22□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 ACM1YPL267W 630 nt2.22□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 YOL098CYOL098C 3114 nt2.22□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 MAD1YGL086W 2250 nt2.22□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 YDR239CYDR239C 2364 nt2.22□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 STE11YLR362W 2154 nt2.22□□□□□ -2.05
YKR011CQ02209 LRE1YCL051W 1752 nt2.21□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 SPF1YEL031W 3648 nt2.21□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 NEW1YPL226W 3591 nt2.21□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 snR70snR70 164 nt2.21□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 DNA2YHR164C 4569 nt2.21□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 COF1YLL050C 432 nt2.21□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 SVL3YPL032C 2478 nt2.21□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 SYH1YPL105C 2550 nt2.21□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 NOC3YLR002C 1992 nt2.21□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 YFR016CYFR016C 3702 nt2.2□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 APL2YKL135C 2181 nt2.2□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 RTT107YHR154W 3213 nt2.2□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 CHC1YGL206C 4962 nt2.2□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.2□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 MSH5YDL154W 2706 nt2.2□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 PHO91YNR013C 2685 nt2.19□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 SDH6YDR379C-A 240 nt2.19□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 MLH3YPL164C 2148 nt2.19□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 PET309YLR067C 2898 nt2.18□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 RPL31AYDL075W 342 nt2.18□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 RPL37BYDR500C 267 nt2.18□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 TIM9YEL020W-A 264 nt2.18□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 PDR3YBL005W 2931 nt2.18□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.17□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 UBP1YDL122W 2430 nt2.17□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 SCD5YOR329C 2619 nt2.17□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 YIR044CYIR044C 186 nt2.17□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 YOR345CYOR345C 351 nt2.17□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt2.17□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 YLL007CYLL007C 1998 nt2.17□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 MSB1YOR188W 3414 nt2.17□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 SGM1YJR134C 2124 nt2.16□□□□□ -2.06
YKR011CQ02209 CTR9YOL145C 3234 nt2.15□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 PAU3YCR104W 375 nt2.15□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 VTC1YER072W 390 nt2.15□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 DGR2YKL121W 2559 nt2.15□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 RTT101YJL047C 2529 nt2.15□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 SGS1YMR190C 4344 nt2.14□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 AGC1YPR021C 2709 nt2.14□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 HMI1YOL095C 2121 nt2.14□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 SIR3YLR442C 2937 nt2.14□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 YGR164WYGR164W 336 nt2.14□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 RPL33BYOR234C 324 nt2.14□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 PIG1YLR273C 1947 nt2.14□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 PTP2YOR208W 2253 nt2.14□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 CUL3YGR003W 2235 nt2.13□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.13□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 YDL196WYDL196W 330 nt2.13□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 Q0143Q0143 153 nt2.13□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt2.13□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 NCA2YPR155C 1851 nt2.13□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 BUD2YKL092C 3315 nt2.12□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 YEL073CYEL073C 324 nt2.12□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt2.12□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 YPR097WYPR097W 3222 nt2.12□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 IRE1YHR079C 3348 nt2.12□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 PMP1YCR024C-A 123 nt2.11□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 YHR210CYHR210C 1026 nt2.11□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 PIP2YOR363C 2991 nt2.11□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 AIM44YPL158C 2277 nt2.1□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 DNF1YER166W 4716 nt2.1□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 AHC1YOR023C 1701 nt2.1□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 SSD1YDR293C 3753 nt2.1□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 YEF3YLR249W 3135 nt2.1□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 FIG4YNL325C 2640 nt2.09□□□□□ -2.07
YKR011CQ02209 IST2YBR086C 2841 nt2.09□□□□□ -2.08
YKR011CQ02209 COY1YKL179C 2040 nt2.07□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.2 ms