Protein–RNA interactions for Protein: P55268

LAMB2, Laminin subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB2P55268 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
LAMB2P55268 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMB2P55268 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms