Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS1P54277 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS1P54277 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS1P54277 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS1P54277 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS1P54277 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS1P54277 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS1P54277 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS1P54277 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS1P54277 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS1P54277 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS1P54277 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS1P54277 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS1P54277 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS1P54277 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS1P54277 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS1P54277 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS1P54277 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS1P54277 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS1P54277 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS1P54277 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS1P54277 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS1P54277 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS1P54277 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS1P54277 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS1P54277 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS1P54277 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS1P54277 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS1P54277 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS1P54277 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS1P54277 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS1P54277 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS1P54277 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS1P54277 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS1P54277 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS1P54277 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS1P54277 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS1P54277 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS1P54277 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS1P54277 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS1P54277 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS1P54277 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS1P54277 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS1P54277 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS1P54277 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PMS1P54277 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PMS1P54277 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PMS1P54277 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PMS1P54277 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PMS1P54277 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PMS1P54277 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PMS1P54277 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMS1P54277 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMS1P54277 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMS1P54277 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMS1P54277 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMS1P54277 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMS1P54277 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS1P54277 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS1P54277 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS1P54277 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS1P54277 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS1P54277 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS1P54277 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS1P54277 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS1P54277 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS1P54277 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS1P54277 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS1P54277 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS1P54277 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS1P54277 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS1P54277 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS1P54277 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS1P54277 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS1P54277 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS1P54277 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS1P54277 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS1P54277 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS1P54277 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS1P54277 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS1P54277 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS1P54277 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS1P54277 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS1P54277 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS1P54277 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS1P54277 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS1P54277 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS1P54277 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS1P54277 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS1P54277 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS1P54277 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS1P54277 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS1P54277 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS1P54277 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS1P54277 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS1P54277 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS1P54277 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS1P54277 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS1P54277 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS1P54277 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms