Protein–RNA interactions for Protein: P53152

MMS2, Ubiquitin-conjugating enzyme variant MMS2, yeastyeast

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MMS2P53152 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.47□□□□□ -2.33
MMS2P53152 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.47□□□□□ -2.33
MMS2P53152 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.47□□□□□ -2.33
MMS2P53152 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.47□□□□□ -2.33
MMS2P53152 CMC4YMR194C-B 222 nt0.47□□□□□ -2.33
MMS2P53152 YJR003CYJR003C 1560 nt0.46□□□□□ -2.34
MMS2P53152 YDR269CYDR269C 324 nt0.46□□□□□ -2.34
MMS2P53152 YGL239CYGL239C 315 nt0.46□□□□□ -2.34
MMS2P53152 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.46□□□□□ -2.34
MMS2P53152 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt0.46□□□□□ -2.34
MMS2P53152 YKL044WYKL044W 321 nt0.46□□□□□ -2.34
MMS2P53152 NHP2YDL208W 471 nt0.45□□□□□ -2.34
MMS2P53152 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt0.45□□□□□ -2.34
MMS2P53152 YNL050CYNL050C 813 nt0.45□□□□□ -2.34
MMS2P53152 YOR282WYOR282W 321 nt0.45□□□□□ -2.34
MMS2P53152 RPL9AYGL147C 576 nt0.44□□□□□ -2.34
MMS2P53152 YHL042WYHL042W 453 nt0.44□□□□□ -2.34
MMS2P53152 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt0.44□□□□□ -2.34
MMS2P53152 ZIP2YGL249W 2115 nt0.44□□□□□ -2.34
MMS2P53152 YMR160WYMR160W 2451 nt0.43□□□□□ -2.34
MMS2P53152 BFR2YDR299W 1605 nt0.43□□□□□ -2.34
MMS2P53152 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.43□□□□□ -2.34
MMS2P53152 GPG1YGL121C 381 nt0.43□□□□□ -2.34
MMS2P53152 PHS1YJL097W 654 nt0.43□□□□□ -2.34
MMS2P53152 LOA1YPR139C 903 nt0.43□□□□□ -2.34
MMS2P53152 YDR521WYDR521W 336 nt0.42□□□□□ -2.34
MMS2P53152 HUR1YGL168W 333 nt0.42□□□□□ -2.34
MMS2P53152 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.42□□□□□ -2.34
MMS2P53152 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.42□□□□□ -2.34
MMS2P53152 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.42□□□□□ -2.34
MMS2P53152 Q0255Q0255 1419 nt0.41□□□□□ -2.34
MMS2P53152 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.41□□□□□ -2.34
MMS2P53152 YER135CYER135C 393 nt0.41□□□□□ -2.34
MMS2P53152 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt0.41□□□□□ -2.34
MMS2P53152 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.41□□□□□ -2.34
MMS2P53152 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.41□□□□□ -2.34
MMS2P53152 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.41□□□□□ -2.34
MMS2P53152 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.41□□□□□ -2.34
MMS2P53152 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.41□□□□□ -2.34
MMS2P53152 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.41□□□□□ -2.34
MMS2P53152 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.41□□□□□ -2.34
MMS2P53152 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.41□□□□□ -2.34
MMS2P53152 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.41□□□□□ -2.34
MMS2P53152 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.41□□□□□ -2.34
MMS2P53152 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.41□□□□□ -2.34
MMS2P53152 URM1YIL008W 300 nt0.41□□□□□ -2.34
MMS2P53152 BER1YLR412W 825 nt0.41□□□□□ -2.34
MMS2P53152 PMP1YCR024C-A 123 nt0.4□□□□□ -2.35
MMS2P53152 snR13snR13 124 nt0.4□□□□□ -2.35
MMS2P53152 SVS1YPL163C 783 nt0.4□□□□□ -2.35
MMS2P53152 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.39□□□□□ -2.35
MMS2P53152 YCK3YER123W 1575 nt0.39□□□□□ -2.35
MMS2P53152 YSP1YHR155W 3687 nt0.39□□□□□ -2.35
MMS2P53152 NOP9YJL010C 2001 nt0.38□□□□□ -2.35
MMS2P53152 CHS6YJL099W 2241 nt0.38□□□□□ -2.35
MMS2P53152 EFR3YMR212C 2349 nt0.38□□□□□ -2.35
MMS2P53152 GEA2YEL022W 4380 nt0.38□□□□□ -2.35
MMS2P53152 YGR025WYGR025W 303 nt0.38□□□□□ -2.35
MMS2P53152 YJL135WYJL135W 318 nt0.37□□□□□ -2.35
MMS2P53152 UTP20YBL004W 7482 nt0.37□□□□□ -2.35
MMS2P53152 NPR2YEL062W 1848 nt0.36□□□□□ -2.35
MMS2P53152 WIP1YDR374W-A 270 nt0.35□□□□□ -2.35
MMS2P53152 YJR141WYJR141W 1044 nt0.35□□□□□ -2.35
MMS2P53152 YOL014WYOL014W 375 nt0.35□□□□□ -2.35
MMS2P53152 YPL182CYPL182C 384 nt0.35□□□□□ -2.35
MMS2P53152 PKH2YOL100W 3246 nt0.34□□□□□ -2.35
MMS2P53152 YDL016CYDL016C 303 nt0.33□□□□□ -2.36
MMS2P53152 YDR029WYDR029W 315 nt0.33□□□□□ -2.36
MMS2P53152 PAU12YGR294W 363 nt0.33□□□□□ -2.36
MMS2P53152 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.33□□□□□ -2.36
MMS2P53152 RPS27AYKL156W 249 nt0.33□□□□□ -2.36
MMS2P53152 RPL26AYLR344W 384 nt0.33□□□□□ -2.36
MMS2P53152 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.33□□□□□ -2.36
MMS2P53152 YOR218CYOR218C 420 nt0.33□□□□□ -2.36
MMS2P53152 TSC3YBR058C-A 243 nt0.33□□□□□ -2.36
MMS2P53152 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.32□□□□□ -2.36
MMS2P53152 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.32□□□□□ -2.36
MMS2P53152 QCR9YGR183C 201 nt0.32□□□□□ -2.36
MMS2P53152 YKL202WYKL202W 582 nt0.32□□□□□ -2.36
MMS2P53152 UBC7YMR022W 498 nt0.32□□□□□ -2.36
MMS2P53152 YOL160WYOL160W 342 nt0.32□□□□□ -2.36
MMS2P53152 TRS65YGR166W 1683 nt0.32□□□□□ -2.36
MMS2P53152 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.31□□□□□ -2.36
MMS2P53152 ABF2YMR072W 552 nt0.31□□□□□ -2.36
MMS2P53152 YPL261CYPL261C 309 nt0.31□□□□□ -2.36
MMS2P53152 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.3□□□□□ -2.36
MMS2P53152 RPB10YOR210W 213 nt0.29□□□□□ -2.36
MMS2P53152 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.29□□□□□ -2.36
MMS2P53152 RAD34YDR314C 2079 nt0.28□□□□□ -2.36
MMS2P53152 YDR344CYDR344C 444 nt0.28□□□□□ -2.36
MMS2P53152 RPS24BYIL069C 408 nt0.28□□□□□ -2.36
MMS2P53152 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.28□□□□□ -2.36
MMS2P53152 SNU56YDR240C 1479 nt0.28□□□□□ -2.37
MMS2P53152 RPL26BYGR034W 384 nt0.27□□□□□ -2.37
MMS2P53152 UBX4YMR067C 1251 nt0.27□□□□□ -2.37
MMS2P53152 CDC33YOL139C 642 nt0.27□□□□□ -2.37
MMS2P53152 YPL044CYPL044C 549 nt0.27□□□□□ -2.37
MMS2P53152 YIR044CYIR044C 186 nt0.26□□□□□ -2.37
MMS2P53152 BEM3YPL115C 3387 nt0.25□□□□□ -2.37
MMS2P53152 TIM13YGR181W 318 nt0.25□□□□□ -2.37
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