Protein–RNA interactions for Protein: P40018

SMB1, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMB1P40018 YML108WYML108W 318 nt0.81□□□□□ -2.28
SMB1P40018 HCH1YNL281W 462 nt0.81□□□□□ -2.28
SMB1P40018 ALY2YJL084C 3141 nt0.81□□□□□ -2.28
SMB1P40018 DOP1YDR141C 5097 nt0.81□□□□□ -2.28
SMB1P40018 CDC39YCR093W 6327 nt0.8□□□□□ -2.28
SMB1P40018 YOR199WYOR199W 330 nt0.8□□□□□ -2.28
SMB1P40018 ZIP2YGL249W 2115 nt0.8□□□□□ -2.28
SMB1P40018 IFH1YLR223C 3258 nt0.79□□□□□ -2.28
SMB1P40018 YHR125WYHR125W 306 nt0.79□□□□□ -2.28
SMB1P40018 YHR130CYHR130C 336 nt0.79□□□□□ -2.28
SMB1P40018 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.79□□□□□ -2.28
SMB1P40018 TIM13YGR181W 318 nt0.78□□□□□ -2.28
SMB1P40018 NFU1YKL040C 771 nt0.78□□□□□ -2.28
SMB1P40018 PAU24YBR301W 363 nt0.78□□□□□ -2.28
SMB1P40018 YKL202WYKL202W 582 nt0.77□□□□□ -2.29
SMB1P40018 SLD3YGL113W 2007 nt0.77□□□□□ -2.29
SMB1P40018 WAR1YML076C 2835 nt0.77□□□□□ -2.29
SMB1P40018 YJR003CYJR003C 1560 nt0.75□□□□□ -2.29
SMB1P40018 YDL158CYDL158C 309 nt0.75□□□□□ -2.29
SMB1P40018 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.75□□□□□ -2.29
SMB1P40018 RPB10YOR210W 213 nt0.75□□□□□ -2.29
SMB1P40018 COG4YPR105C 2586 nt0.75□□□□□ -2.29
SMB1P40018 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.74□□□□□ -2.29
SMB1P40018 YBL071CYBL071C 309 nt0.74□□□□□ -2.29
SMB1P40018 ERP4YOR016C 624 nt0.74□□□□□ -2.29
SMB1P40018 AIM29YKR074W 468 nt0.73□□□□□ -2.29
SMB1P40018 ZEO1YOL109W 342 nt0.73□□□□□ -2.29
SMB1P40018 YPR153WYPR153W 423 nt0.73□□□□□ -2.29
SMB1P40018 YDL196WYDL196W 330 nt0.72□□□□□ -2.29
SMB1P40018 GPG1YGL121C 381 nt0.72□□□□□ -2.29
SMB1P40018 YLR287CYLR287C 1068 nt0.72□□□□□ -2.29
SMB1P40018 IES4YOR189W 351 nt0.72□□□□□ -2.29
SMB1P40018 snR54snR54 86 nt0.72□□□□□ -2.29
SMB1P40018 YDL011CYDL011C 324 nt0.71□□□□□ -2.3
SMB1P40018 YJL135WYJL135W 318 nt0.71□□□□□ -2.3
SMB1P40018 CDC33YOL139C 642 nt0.71□□□□□ -2.3
SMB1P40018 UBP3YER151C 2739 nt0.71□□□□□ -2.3
SMB1P40018 YAR009CYAR009C 3591 nt0.71□□□□□ -2.3
SMB1P40018 PAN2YGL094C 3348 nt0.7□□□□□ -2.3
SMB1P40018 ALG13YGL047W 609 nt0.7□□□□□ -2.3
SMB1P40018 YNL122CYNL122C 348 nt0.7□□□□□ -2.3
SMB1P40018 PKH2YOL100W 3246 nt0.7□□□□□ -2.3
SMB1P40018 BI2Q0110 1272 nt0.69□□□□□ -2.3
SMB1P40018 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.69□□□□□ -2.3
SMB1P40018 HUG1YML058W-A 207 nt0.69□□□□□ -2.3
SMB1P40018 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.69□□□□□ -2.3
SMB1P40018 DBP6YNR038W 1890 nt0.69□□□□□ -2.3
SMB1P40018 PAC1YOR269W 1485 nt0.68□□□□□ -2.3
SMB1P40018 WIP1YDR374W-A 270 nt0.68□□□□□ -2.3
SMB1P40018 STF2YGR008C 255 nt0.68□□□□□ -2.3
SMB1P40018 ECL1YGR146C 636 nt0.68□□□□□ -2.3
SMB1P40018 DIE2YGR227W 1578 nt0.68□□□□□ -2.3
SMB1P40018 YGR290WYGR290W 444 nt0.68□□□□□ -2.3
SMB1P40018 PAM16YJL104W 450 nt0.68□□□□□ -2.3
SMB1P40018 YOL160WYOL160W 342 nt0.68□□□□□ -2.3
SMB1P40018 YPL261CYPL261C 309 nt0.68□□□□□ -2.3
SMB1P40018 ISD11YER048W-A 285 nt0.67□□□□□ -2.3
SMB1P40018 YOR029WYOR029W 336 nt0.67□□□□□ -2.3
SMB1P40018 YGR042WYGR042W 816 nt0.66□□□□□ -2.3
SMB1P40018 YLR171WYLR171W 390 nt0.66□□□□□ -2.3
SMB1P40018 YPL229WYPL229W 621 nt0.66□□□□□ -2.3
SMB1P40018 GEA2YEL022W 4380 nt0.66□□□□□ -2.3
SMB1P40018 NHP2YDL208W 471 nt0.65□□□□□ -2.31
SMB1P40018 SWF1YDR126W 1011 nt0.65□□□□□ -2.31
SMB1P40018 YDR521WYDR521W 336 nt0.65□□□□□ -2.31
SMB1P40018 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt0.65□□□□□ -2.31
SMB1P40018 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt0.65□□□□□ -2.31
SMB1P40018 LOA1YPR139C 903 nt0.65□□□□□ -2.31
SMB1P40018 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.65□□□□□ -2.31
SMB1P40018 snR51snR51 107 nt0.65□□□□□ -2.31
SMB1P40018 CUL3YGR003W 2235 nt0.64□□□□□ -2.31
SMB1P40018 snR72snR72 98 nt0.64□□□□□ -2.31
SMB1P40018 CMC4YMR194C-B 222 nt0.64□□□□□ -2.31
SMB1P40018 SEC1YDR164C 2175 nt0.63□□□□□ -2.31
SMB1P40018 RAD34YDR314C 2079 nt0.63□□□□□ -2.31
SMB1P40018 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.63□□□□□ -2.31
SMB1P40018 YIR044CYIR044C 186 nt0.63□□□□□ -2.31
SMB1P40018 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.63□□□□□ -2.31
SMB1P40018 YOR282WYOR282W 321 nt0.63□□□□□ -2.31
SMB1P40018 BUD3YCL014W 4911 nt0.63□□□□□ -2.31
SMB1P40018 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.62□□□□□ -2.31
SMB1P40018 FYV7YLR068W 456 nt0.62□□□□□ -2.31
SMB1P40018 YNL058CYNL058C 951 nt0.62□□□□□ -2.31
SMB1P40018 snR189snR189 189 nt0.62□□□□□ -2.31
SMB1P40018 SDH7YDR511W 402 nt0.61□□□□□ -2.31
SMB1P40018 YHL042WYHL042W 453 nt0.61□□□□□ -2.31
SMB1P40018 YKL083WYKL083W 615 nt0.61□□□□□ -2.31
SMB1P40018 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.61□□□□□ -2.31
SMB1P40018 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.61□□□□□ -2.31
SMB1P40018 INP2YMR163C 2118 nt0.61□□□□□ -2.31
SMB1P40018 YHL041WYHL041W 450 nt0.59□□□□□ -2.31
SMB1P40018 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SMB1P40018 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SMB1P40018 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SMB1P40018 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SMB1P40018 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SMB1P40018 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SMB1P40018 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SMB1P40018 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SMB1P40018 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
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