Protein–RNA interactions for Protein: P38344

REI1, Cytoplasmic 60S subunit biogenesis factor REI1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
REI1P38344 VMR1YHL035C 4779 nt2.69□□□□□ -1.98
REI1P38344 INP51YIL002C 2841 nt2.69□□□□□ -1.98
REI1P38344 PUT3YKL015W 2940 nt2.68□□□□□ -1.98
REI1P38344 YCR043CYCR043C 384 nt2.68□□□□□ -1.98
REI1P38344 YDL196WYDL196W 330 nt2.68□□□□□ -1.98
REI1P38344 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.68□□□□□ -1.98
REI1P38344 NCA2YPR155C 1851 nt2.68□□□□□ -1.98
REI1P38344 CBF2YGR140W 2871 nt2.67□□□□□ -1.98
REI1P38344 YFR016CYFR016C 3702 nt2.67□□□□□ -1.98
REI1P38344 PIG1YLR273C 1947 nt2.67□□□□□ -1.98
REI1P38344 SVL3YPL032C 2478 nt2.67□□□□□ -1.98
REI1P38344 BRP1YGL007W 378 nt2.66□□□□□ -1.98
REI1P38344 STE11YLR362W 2154 nt2.66□□□□□ -1.98
REI1P38344 TCB2YNL087W 3537 nt2.65□□□□□ -1.99
REI1P38344 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt2.65□□□□□ -1.99
REI1P38344 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt2.65□□□□□ -1.99
REI1P38344 FAR11YNL127W 2862 nt2.65□□□□□ -1.99
REI1P38344 SPF1YEL031W 3648 nt2.64□□□□□ -1.99
REI1P38344 SGS1YMR190C 4344 nt2.64□□□□□ -1.99
REI1P38344 YDR544CYDR544C 429 nt2.64□□□□□ -1.99
REI1P38344 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.64□□□□□ -1.99
REI1P38344 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt2.64□□□□□ -1.99
REI1P38344 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt2.64□□□□□ -1.99
REI1P38344 RLM1YPL089C 2031 nt2.64□□□□□ -1.99
REI1P38344 YEF3YLR249W 3135 nt2.63□□□□□ -1.99
REI1P38344 PAU3YCR104W 375 nt2.63□□□□□ -1.99
REI1P38344 YCL046WYCL046W 324 nt2.63□□□□□ -1.99
REI1P38344 KRE33YNL132W 3171 nt2.63□□□□□ -1.99
REI1P38344 HOS4YIL112W 3252 nt2.62□□□□□ -1.99
REI1P38344 FIG4YNL325C 2640 nt2.62□□□□□ -1.99
REI1P38344 RPS29AYLR388W 171 nt2.62□□□□□ -1.99
REI1P38344 NAM7YMR080C 2916 nt2.62□□□□□ -1.99
REI1P38344 RAD34YDR314C 2079 nt2.61□□□□□ -1.99
REI1P38344 VTC3YPL019C 2508 nt2.61□□□□□ -1.99
REI1P38344 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.61□□□□□ -1.99
REI1P38344 YJL022WYJL022W 309 nt2.61□□□□□ -1.99
REI1P38344 ATP7YKL016C 525 nt2.61□□□□□ -1.99
REI1P38344 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.61□□□□□ -1.99
REI1P38344 ZRG17YNR039C 1818 nt2.61□□□□□ -1.99
REI1P38344 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt2.6□□□□□ -1.99
REI1P38344 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.6□□□□□ -1.99
REI1P38344 YOR102WYOR102W 351 nt2.6□□□□□ -1.99
REI1P38344 APL5YPL195W 2799 nt2.6□□□□□ -1.99
REI1P38344 NOC3YLR002C 1992 nt2.6□□□□□ -1.99
REI1P38344 YMR326CYMR326C 309 nt2.59□□□□□ -1.99
REI1P38344 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt2.59□□□□□ -1.99
REI1P38344 AIM44YPL158C 2277 nt2.59□□□□□ -1.99
REI1P38344 TRS130YMR218C 3309 nt2.59□□□□□ -2
REI1P38344 TFB5YDR079C-A 219 nt2.58□□□□□ -2
REI1P38344 ZIP2YGL249W 2115 nt2.58□□□□□ -2
REI1P38344 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.58□□□□□ -2
REI1P38344 CAT2YML042W 2013 nt2.58□□□□□ -2
REI1P38344 ENV11YGR071C 2583 nt2.57□□□□□ -2
REI1P38344 TOR1YJR066W 7413 nt2.57□□□□□ -2
REI1P38344 HSH155YMR288W 2916 nt2.57□□□□□ -2
REI1P38344 RPL31AYDL075W 342 nt2.57□□□□□ -2
REI1P38344 AMS1YGL156W 3252 nt2.57□□□□□ -2
REI1P38344 DNF1YER166W 4716 nt2.57□□□□□ -2
REI1P38344 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.56□□□□□ -2
REI1P38344 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.56□□□□□ -2
REI1P38344 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.56□□□□□ -2
REI1P38344 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.56□□□□□ -2
REI1P38344 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.56□□□□□ -2
REI1P38344 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.56□□□□□ -2
REI1P38344 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.55□□□□□ -2
REI1P38344 snR70snR70 164 nt2.55□□□□□ -2
REI1P38344 MAD1YGL086W 2250 nt2.55□□□□□ -2
REI1P38344 PHO91YNR013C 2685 nt2.55□□□□□ -2
REI1P38344 AHC1YOR023C 1701 nt2.55□□□□□ -2
REI1P38344 DNA2YHR164C 4569 nt2.55□□□□□ -2
REI1P38344 NAB6YML117W 3405 nt2.55□□□□□ -2
REI1P38344 PIP2YOR363C 2991 nt2.55□□□□□ -2
REI1P38344 SAS3YBL052C 2496 nt2.54□□□□□ -2
REI1P38344 NOP14YDL148C 2433 nt2.54□□□□□ -2
REI1P38344 YDR341CYDR341C 1824 nt2.54□□□□□ -2
REI1P38344 FKS3YMR306W 5358 nt2.54□□□□□ -2
REI1P38344 VPS8YAL002W 3825 nt2.54□□□□□ -2
REI1P38344 IRA2YOL081W 9240 nt2.54□□□□□ -2
REI1P38344 ZIP1YDR285W 2628 nt2.54□□□□□ -2
REI1P38344 VPS13YLL040C 9435 nt2.54□□□□□ -2
REI1P38344 MSB1YOR188W 3414 nt2.54□□□□□ -2
REI1P38344 YPL044CYPL044C 549 nt2.53□□□□□ -2
REI1P38344 BUB1YGR188C 3066 nt2.53□□□□□ -2
REI1P38344 YPP1YGR198W 2454 nt2.52□□□□□ -2.01
REI1P38344 RPS17AYML024W 411 nt2.52□□□□□ -2.01
REI1P38344 APL2YKL135C 2181 nt2.51□□□□□ -2.01
REI1P38344 YER053C-AYER053C-A 114 nt2.51□□□□□ -2.01
REI1P38344 YHR217CYHR217C 462 nt2.51□□□□□ -2.01
REI1P38344 MET18YIL128W 3099 nt2.5□□□□□ -2.01
REI1P38344 YNL018CYNL018C 1839 nt2.5□□□□□ -2.01
REI1P38344 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt2.5□□□□□ -2.01
REI1P38344 PDR11YIL013C 4236 nt2.5□□□□□ -2.01
REI1P38344 SCD5YOR329C 2619 nt2.5□□□□□ -2.01
REI1P38344 IRC8YJL051W 2469 nt2.49□□□□□ -2.01
REI1P38344 TUS1YLR425W 3924 nt2.49□□□□□ -2.01
REI1P38344 DCP2YNL118C 2913 nt2.49□□□□□ -2.01
REI1P38344 SLD3YGL113W 2007 nt2.49□□□□□ -2.01
REI1P38344 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt2.48□□□□□ -2.01
REI1P38344 IFH1YLR223C 3258 nt2.48□□□□□ -2.01
REI1P38344 PTP2YOR208W 2253 nt2.48□□□□□ -2.01
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