Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 ECM15YBL001C 315 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 CRS5YOR031W 210 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 YPR203WYPR203W 309 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 PTP2YOR208W 2253 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 RGR1YLR071C 3249 nt2.9□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 PAU8YAL068C 363 nt2.9□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 PAU18YLL064C 363 nt2.9□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 PAU6YNR076W 363 nt2.9□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 PAU20YOL161C 363 nt2.9□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 RPS30BYOR182C 192 nt2.9□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 MDN1YLR106C 14733 nt2.9□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 SPO22YIL073C 2928 nt2.9□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 VTC3YPL019C 2508 nt2.9□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 YME2YMR302C 2553 nt2.9□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 ARO1YDR127W 4767 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 RPS28BYLR264W 204 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 DCP2YNL118C 2913 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 DUG2YBR281C 2637 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 KIN2YLR096W 3444 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 DYN2YDR424C 279 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 MMS22YLR320W 4365 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 VMR1YHL035C 4779 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 ZIP1YDR285W 2628 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 ECM21YBL101C 3354 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 SRO77YBL106C 3033 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 ROM1YGR070W 3468 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 YGR067CYGR067C 2415 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 MAD1YGL086W 2250 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 NAM7YMR080C 2916 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 INP53YOR109W 3324 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 COX12YLR038C 252 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 SLA1YBL007C 3735 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 SNQ2YDR011W 4506 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 MGM1YOR211C 2646 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 SWR1YDR334W 4545 nt2.85□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 STT4YLR305C 5703 nt2.85□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.85□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 SDC25YLL016W 3147 nt2.85□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 DGR2YKL121W 2559 nt2.84□□□□□ -1.95
TY1A-DR3Q12441 ARO80YDR421W 2853 nt2.84□□□□□ -1.96
TY1A-DR3Q12441 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt2.83□□□□□ -1.96
TY1A-DR3Q12441 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.83□□□□□ -1.96
TY1A-DR3Q12441 ACB1YGR037C 264 nt2.83□□□□□ -1.96
TY1A-DR3Q12441 YSP2YDR326C 4317 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1A-DR3Q12441 FIR1YER032W 2631 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1A-DR3Q12441 CIN8YEL061C 3003 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1A-DR3Q12441 CAT2YML042W 2013 nt2.81□□□□□ -1.96
TY1A-DR3Q12441 MET6YER091C 2304 nt2.81□□□□□ -1.96
TY1A-DR3Q12441 CDC53YDL132W 2448 nt2.81□□□□□ -1.96
TY1A-DR3Q12441 VAS1YGR094W 3315 nt2.81□□□□□ -1.96
TY1A-DR3Q12441 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt2.81□□□□□ -1.96
TY1A-DR3Q12441 KTI11YBL071W-A 249 nt2.81□□□□□ -1.96
TY1A-DR3Q12441 DRS2YAL026C 4068 nt2.8□□□□□ -1.96
TY1A-DR3Q12441 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt2.8□□□□□ -1.96
TY1A-DR3Q12441 RPS22AYJL190C 393 nt2.8□□□□□ -1.96
TY1A-DR3Q12441 KAP104YBR017C 2757 nt2.8□□□□□ -1.96
TY1A-DR3Q12441 NOP14YDL148C 2433 nt2.79□□□□□ -1.96
TY1A-DR3Q12441 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt2.79□□□□□ -1.96
TY1A-DR3Q12441 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.79□□□□□ -1.96
TY1A-DR3Q12441 ESL1YIL151C 3357 nt2.79□□□□□ -1.96
TY1A-DR3Q12441 SAP190YKR028W 3102 nt2.78□□□□□ -1.96
TY1A-DR3Q12441 YBT1YLL048C 4986 nt2.78□□□□□ -1.97
TY1A-DR3Q12441 TTI1YKL033W 3117 nt2.77□□□□□ -1.97
TY1A-DR3Q12441 SMC6YLR383W 3345 nt2.77□□□□□ -1.97
TY1A-DR3Q12441 PHO91YNR013C 2685 nt2.76□□□□□ -1.97
TY1A-DR3Q12441 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt2.76□□□□□ -1.97
TY1A-DR3Q12441 LRG1YDL240W 3054 nt2.76□□□□□ -1.97
TY1A-DR3Q12441 STE11YLR362W 2154 nt2.76□□□□□ -1.97
TY1A-DR3Q12441 IRC8YJL051W 2469 nt2.75□□□□□ -1.97
TY1A-DR3Q12441 QCR9YGR183C 201 nt2.75□□□□□ -1.97
TY1A-DR3Q12441 TFC4YGR047C 3078 nt2.75□□□□□ -1.97
TY1A-DR3Q12441 YLL054CYLL054C 2532 nt2.75□□□□□ -1.97
TY1A-DR3Q12441 SKP2YNL311C 2292 nt2.75□□□□□ -1.97
TY1A-DR3Q12441 BUB1YGR188C 3066 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1A-DR3Q12441 MAK10YEL053C 2202 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1A-DR3Q12441 APL2YKL135C 2181 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1A-DR3Q12441 FLO11YIR019C 4104 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1A-DR3Q12441 BUD4YJR092W 4344 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1A-DR3Q12441 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1A-DR3Q12441 REC8YPR007C 2043 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1A-DR3Q12441 HSH155YMR288W 2916 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1A-DR3Q12441 ISW1YBR245C 3390 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1A-DR3Q12441 IFH1YLR223C 3258 nt2.73□□□□□ -1.97
TY1A-DR3Q12441 MRD1YPR112C 2664 nt2.73□□□□□ -1.97
TY1A-DR3Q12441 TMA17YDL110C 453 nt2.73□□□□□ -1.97
TY1A-DR3Q12441 YGL182CYGL182C 324 nt2.73□□□□□ -1.97
TY1A-DR3Q12441 UTP8YGR128C 2142 nt2.73□□□□□ -1.97
TY1A-DR3Q12441 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt2.73□□□□□ -1.97
TY1A-DR3Q12441 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.72□□□□□ -1.97
TY1A-DR3Q12441 APL1YJR005W 2103 nt2.72□□□□□ -1.97
TY1A-DR3Q12441 RPO41YFL036W 4056 nt2.72□□□□□ -1.97
TY1A-DR3Q12441 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt2.71□□□□□ -1.98
TY1A-DR3Q12441 SLH1YGR271W 5904 nt2.71□□□□□ -1.98
TY1A-DR3Q12441 SSN2YDR443C 4263 nt2.71□□□□□ -1.98
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