Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 GLC3YEL011W 2115 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 PDR12YPL058C 4536 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 RPS28BYLR264W 204 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 snR53snR53 91 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 YAT2YER024W 2772 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 POL2YNL262W 6669 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 RSF2YJR127C 4143 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 MNL2YLR057W 2550 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 SUL1YBR294W 2580 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 snR39BsnR39B 96 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 RRP6YOR001W 2202 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 RGA2YDR379W 3030 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 REC8YPR007C 2043 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 KAP123YER110C 3342 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 HRD3YLR207W 2502 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 PSY2YNL201C 2577 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 YSP2YDR326C 4317 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 INP53YOR109W 3324 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 CSR2YPR030W 3366 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 TAE2YPL009C 3117 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 NAM7YMR080C 2916 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 STB6YKL072W 2301 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 HMI1YOL095C 2121 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 SET1YHR119W 3243 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 MET5YJR137C 4329 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 SKP2YNL311C 2292 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 CHS2YBR038W 2892 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 FYV10YIL097W 1551 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 TFC1YBR123C 1950 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 COX5BYIL111W 456 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 PAU8YAL068C 363 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 PAU18YLL064C 363 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 PAU6YNR076W 363 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 PAU20YOL161C 363 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 STB4YMR019W 2850 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 CAT2YML042W 2013 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 IRR1YIL026C 3453 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 YTA7YGR270W 4140 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 TTI1YKL033W 3117 nt2.9□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 ENA2YDR039C 3276 nt2.9□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 ENA1YDR040C 3276 nt2.9□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 SRO77YBL106C 3033 nt2.9□□□□□ -1.94
TY1A-BLQ12266 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.9□□□□□ -1.95
TY1A-BLQ12266 DNL4YOR005C 2835 nt2.9□□□□□ -1.95
TY1A-BLQ12266 PTP2YOR208W 2253 nt2.9□□□□□ -1.95
TY1A-BLQ12266 RAD5YLR032W 3510 nt2.9□□□□□ -1.95
TY1A-BLQ12266 YME2YMR302C 2553 nt2.9□□□□□ -1.95
TY1A-BLQ12266 CIN8YEL061C 3003 nt2.9□□□□□ -1.95
TY1A-BLQ12266 PRP6YBR055C 2700 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1A-BLQ12266 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1A-BLQ12266 MAD1YGL086W 2250 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1A-BLQ12266 CRM1YGR218W 3255 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1A-BLQ12266 LHS1YKL073W 2646 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1A-BLQ12266 YBT1YLL048C 4986 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1A-BLQ12266 CRS5YOR031W 210 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1A-BLQ12266 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1A-BLQ12266 DGR2YKL121W 2559 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1A-BLQ12266 AFI1YOR129C 2682 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1A-BLQ12266 IFH1YLR223C 3258 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1A-BLQ12266 DUG2YBR281C 2637 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1A-BLQ12266 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1A-BLQ12266 SAS3YBL052C 2496 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1A-BLQ12266 VMR1YHL035C 4779 nt2.85□□□□□ -1.95
TY1A-BLQ12266 SPO22YIL073C 2928 nt2.85□□□□□ -1.95
TY1A-BLQ12266 YDR521WYDR521W 336 nt2.85□□□□□ -1.95
TY1A-BLQ12266 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.85□□□□□ -1.95
TY1A-BLQ12266 YMR317WYMR317W 3423 nt2.85□□□□□ -1.95
TY1A-BLQ12266 LRG1YDL240W 3054 nt2.84□□□□□ -1.95
TY1A-BLQ12266 SPO71YDR104C 3738 nt2.84□□□□□ -1.95
TY1A-BLQ12266 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.84□□□□□ -1.95
TY1A-BLQ12266 RPN1YHR027C 2982 nt2.84□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 YHR080CYHR080C 4038 nt2.84□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 ZRG8YER033C 3231 nt2.83□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 YDR186CYDR186C 2634 nt2.83□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 YLL020CYLL020C 306 nt2.83□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt2.83□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 KTI11YBL071W-A 249 nt2.83□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 SWR1YDR334W 4545 nt2.83□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 AKR1YDR264C 2295 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 DRS2YAL026C 4068 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 TSC11YER093C 4293 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 ROM1YGR070W 3468 nt2.81□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 MLH1YMR167W 2310 nt2.81□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 YPP1YGR198W 2454 nt2.81□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 SAP190YKR028W 3102 nt2.81□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 STT4YLR305C 5703 nt2.81□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 YER078W-AYER078W-A 165 nt2.81□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 SNC1YAL030W 354 nt2.81□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt2.81□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 69.7 ms