Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

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Length 1,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 UBP14YBR058C 2346 nt3.7□□□□□ -1.82
NCR1Q12200 MAK10YEL053C 2202 nt3.7□□□□□ -1.82
NCR1Q12200 SNT1YCR033W 3681 nt3.69□□□□□ -1.82
NCR1Q12200 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt3.69□□□□□ -1.82
NCR1Q12200 TRS120YDR407C 3870 nt3.69□□□□□ -1.82
NCR1Q12200 FUN30YAL019W 3396 nt3.69□□□□□ -1.82
NCR1Q12200 ATG11YPR049C 3537 nt3.69□□□□□ -1.82
NCR1Q12200 SPT6YGR116W 4356 nt3.67□□□□□ -1.82
NCR1Q12200 CCM1YGR150C 2595 nt3.67□□□□□ -1.82
NCR1Q12200 EXO84YBR102C 2262 nt3.67□□□□□ -1.82
NCR1Q12200 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt3.67□□□□□ -1.82
NCR1Q12200 INP53YOR109W 3324 nt3.67□□□□□ -1.82
NCR1Q12200 MMS4YBR098W 2076 nt3.66□□□□□ -1.82
NCR1Q12200 CRM1YGR218W 3255 nt3.66□□□□□ -1.82
NCR1Q12200 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.65□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 VID27YNL212W 2349 nt3.64□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 YDR210WYDR210W 228 nt3.64□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.64□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.64□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 RGM1YMR182C 636 nt3.64□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 NAM7YMR080C 2916 nt3.64□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 MET10YFR030W 3108 nt3.64□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 AKR1YDR264C 2295 nt3.63□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 YPL150WYPL150W 2706 nt3.63□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 OSH3YHR073W 2991 nt3.63□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 APL2YKL135C 2181 nt3.63□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 YPP1YGR198W 2454 nt3.63□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 MLH1YMR167W 2310 nt3.62□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 SWI5YDR146C 2130 nt3.62□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 PSK2YOL045W 3306 nt3.62□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 UBP11YKR098C 2154 nt3.62□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 PAU10YDR542W 363 nt3.62□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 PAU11YGL261C 363 nt3.62□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 SPT4YGR063C 309 nt3.62□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 PAU4YLR461W 363 nt3.62□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 ITC1YGL133W 3795 nt3.61□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 ORC1YML065W 2745 nt3.61□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 EMC1YCL045C 2283 nt3.61□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 KAP95YLR347C 2586 nt3.6□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.6□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 MYO3YKL129C 3819 nt3.6□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 CHS3YBR023C 3498 nt3.6□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 MTR4YJL050W 3222 nt3.59□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 APL4YPR029C 2499 nt3.59□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.59□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.59□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.59□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.59□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.59□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.59□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.59□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.59□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.59□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 YKL225WYKL225W 348 nt3.59□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 NPR3YHL023C 3441 nt3.59□□□□□ -1.83
NCR1Q12200 IRR1YIL026C 3453 nt3.58□□□□□ -1.84
NCR1Q12200 CPA2YJR109C 3357 nt3.58□□□□□ -1.84
NCR1Q12200 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt3.58□□□□□ -1.84
NCR1Q12200 SNC1YAL030W 354 nt3.58□□□□□ -1.84
NCR1Q12200 ANB1YJR047C 474 nt3.57□□□□□ -1.84
NCR1Q12200 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt3.57□□□□□ -1.84
NCR1Q12200 YLR232WYLR232W 348 nt3.57□□□□□ -1.84
NCR1Q12200 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt3.57□□□□□ -1.84
NCR1Q12200 HEF3YNL014W 3135 nt3.57□□□□□ -1.84
NCR1Q12200 DNL4YOR005C 2835 nt3.57□□□□□ -1.84
NCR1Q12200 URA2YJL130C 6645 nt3.56□□□□□ -1.84
NCR1Q12200 FLO10YKR102W 3510 nt3.56□□□□□ -1.84
NCR1Q12200 MAK21YDR060W 3078 nt3.56□□□□□ -1.84
NCR1Q12200 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt3.56□□□□□ -1.84
NCR1Q12200 ALK1YGL021W 2283 nt3.55□□□□□ -1.84
NCR1Q12200 PTP2YOR208W 2253 nt3.55□□□□□ -1.84
NCR1Q12200 POM152YMR129W 4014 nt3.55□□□□□ -1.84
NCR1Q12200 GSC2YGR032W 5688 nt3.55□□□□□ -1.84
NCR1Q12200 RGA2YDR379W 3030 nt3.54□□□□□ -1.84
NCR1Q12200 YLR041WYLR041W 321 nt3.54□□□□□ -1.84
NCR1Q12200 CRS5YOR031W 210 nt3.54□□□□□ -1.84
NCR1Q12200 PHO81YGR233C 3537 nt3.53□□□□□ -1.84
NCR1Q12200 INP52YNL106C 3552 nt3.52□□□□□ -1.85
NCR1Q12200 EAF1YDR359C 2949 nt3.52□□□□□ -1.85
NCR1Q12200 RAD26YJR035W 3258 nt3.52□□□□□ -1.85
NCR1Q12200 STE6YKL209C 3873 nt3.51□□□□□ -1.85
NCR1Q12200 TAH1YCR060W 336 nt3.51□□□□□ -1.85
NCR1Q12200 NOP10YHR072W-A 177 nt3.51□□□□□ -1.85
NCR1Q12200 BMS1YPL217C 3552 nt3.51□□□□□ -1.85
NCR1Q12200 PKH1YDR490C 2301 nt3.5□□□□□ -1.85
NCR1Q12200 NEW1YPL226W 3591 nt3.5□□□□□ -1.85
NCR1Q12200 YME2YMR302C 2553 nt3.5□□□□□ -1.85
NCR1Q12200 snR76snR76 109 nt3.5□□□□□ -1.85
NCR1Q12200 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt3.5□□□□□ -1.85
NCR1Q12200 TMA108YIL137C 2841 nt3.5□□□□□ -1.85
NCR1Q12200 DUG2YBR281C 2637 nt3.49□□□□□ -1.85
NCR1Q12200 MDN1YLR106C 14733 nt3.49□□□□□ -1.85
NCR1Q12200 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.49□□□□□ -1.85
NCR1Q12200 KTI11YBL071W-A 249 nt3.49□□□□□ -1.85
NCR1Q12200 SRO77YBL106C 3033 nt3.49□□□□□ -1.85
NCR1Q12200 YTA7YGR270W 4140 nt3.49□□□□□ -1.85
NCR1Q12200 RIC1YLR039C 3171 nt3.48□□□□□ -1.85
NCR1Q12200 CIN8YEL061C 3003 nt3.48□□□□□ -1.85
NCR1Q12200 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.48□□□□□ -1.85
NCR1Q12200 PAU8YAL068C 363 nt3.48□□□□□ -1.85
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