Protein–RNA interactions for Protein: Q02199

NUP49, Nucleoporin NUP49/NSP49, yeastyeast

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP49Q02199 NBL1YHR199C-A 222 nt0.92□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 RPL40BYKR094C 387 nt0.92□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 YLR202CYLR202C 327 nt0.92□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 YLR456WYLR456W 615 nt0.92□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 FMP23YBR047W 528 nt0.92□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 YCL046WYCL046W 324 nt0.92□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.91□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 SEC5YDR166C 2916 nt0.91□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.91□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 YHR125WYHR125W 306 nt0.91□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 YLL020CYLL020C 306 nt0.91□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 YLR171WYLR171W 390 nt0.91□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.91□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 YPR099CYPR099C 357 nt0.91□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 YDL152WYDL152W 366 nt0.9□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 ECL1YGR146C 636 nt0.9□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 TMA22YJR014W 597 nt0.9□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 HCH1YNL281W 462 nt0.9□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 YBR032WYBR032W 303 nt0.9□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 YPL068CYPL068C 882 nt0.9□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 SEC3YER008C 4011 nt0.9□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 PAN3YKL025C 2040 nt0.89□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 RAD50YNL250W 3939 nt0.89□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 YGR265WYGR265W 411 nt0.89□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 URM1YIL008W 300 nt0.89□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 NFU1YKL040C 771 nt0.89□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 PAU18YLL064C 363 nt0.89□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 YNL114CYNL114C 372 nt0.89□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 PAU6YNR076W 363 nt0.89□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.89□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 TIM18YOR297C 579 nt0.89□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 snR54snR54 86 nt0.89□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 SCC2YDR180W 4482 nt0.88□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 YGL217CYGL217C 342 nt0.88□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 RTT102YGR275W 474 nt0.88□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 YLR101CYLR101C 396 nt0.88□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 ERP4YOR016C 624 nt0.88□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 SLX4YLR135W 2247 nt0.88□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 ROM2YLR371W 4071 nt0.87□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 MAK10YEL053C 2202 nt0.87□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 SWI5YDR146C 2130 nt0.87□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 YDR509WYDR509W 348 nt0.87□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.87□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 ZEO1YOL109W 342 nt0.87□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 EAF1YDR359C 2949 nt0.86□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.86□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 YBL073WYBL073W 312 nt0.86□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 CDC39YCR093W 6327 nt0.86□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 TOF2YKR010C 2316 nt0.86□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 SRP14YDL092W 441 nt0.85□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.85□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.85□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.85□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.85□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 HDA3YPR179C 1968 nt0.85□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 IRR1YIL026C 3453 nt0.84□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 SMC1YFL008W 3678 nt0.84□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 PAU2YEL049W 363 nt0.84□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 PHS1YJL097W 654 nt0.84□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 VPS20YMR077C 666 nt0.84□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 RUF22RUF22 515 nt0.84□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 YBL071CYBL071C 309 nt0.84□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 RPL32YBL092W 393 nt0.84□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.84□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 snR14snR14 160 nt0.84□□□□□ -2.27
NUP49Q02199 SGO1YOR073W 1773 nt0.83□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 ZRG17YNR039C 1818 nt0.83□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.83□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 YDR008CYDR008C 351 nt0.83□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 YGL239CYGL239C 315 nt0.83□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 YJR157WYJR157W 363 nt0.83□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 YLR287CYLR287C 1068 nt0.83□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.83□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 PAU24YBR301W 363 nt0.83□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 MKT1YNL085W 2493 nt0.83□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 YLL054CYLL054C 2532 nt0.83□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 GDS1YOR355W 1569 nt0.83□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 WIP1YDR374W-A 270 nt0.82□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 RTR1YER139C 681 nt0.82□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.82□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 YJL007CYJL007C 315 nt0.82□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.82□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 YPL205CYPL205C 345 nt0.82□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 YOP1YPR028W 543 nt0.82□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 VPS54YDR027C 2670 nt0.82□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 KAP120YPL125W 3099 nt0.82□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 STB6YKL072W 2301 nt0.81□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 CBS1YDL069C 690 nt0.81□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 RPL9BYNL067W 576 nt0.81□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 PXA2YKL188C 2562 nt0.81□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 DOP1YDR141C 5097 nt0.81□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 ZIP1YDR285W 2628 nt0.81□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 SWI4YER111C 3282 nt0.8□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 DIE2YGR227W 1578 nt0.8□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 UBC7YMR022W 498 nt0.8□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 IFH1YLR223C 3258 nt0.79□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 TIM13YGR181W 318 nt0.79□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.79□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 YPL182CYPL182C 384 nt0.79□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 LYS14YDR034C 2373 nt0.79□□□□□ -2.28
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