Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHKA1P46020 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHKA1P46020 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms