Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.4 ms