Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CGGBP1Q9UFW8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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