Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXT1Q16394 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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EXT1Q16394 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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EXT1Q16394 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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EXT1Q16394 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXT1Q16394 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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