Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1CQ15572 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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