Protein–RNA interactions for Protein: Q12048

ATG41, Autophagy-related protein 41, yeastyeast

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG41Q12048 IFH1YLR223C 3258 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 HDA3YPR179C 1968 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 PIP2YOR363C 2991 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 SEC1YDR164C 2175 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 YER121WYER121W 345 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 LRP1YHR081W 555 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 YPL197CYPL197C 414 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 APL3YBL037W 3078 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 KAP120YPL125W 3099 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 BI4Q0120 1917 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 snR5snR5 204 nt0.67□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 YGL109WYGL109W 324 nt0.67□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 TIM10YHR005C-A 282 nt0.67□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 NBP1YLR457C 960 nt0.67□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt0.67□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 IRC23YOR044W 474 nt0.67□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 GUP1YGL084C 1683 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 ANS1YHR126C 480 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 YKL111CYKL111C 336 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 SWS2YNL081C 432 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 NUP145YGL092W 3954 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 SRP14YDL092W 441 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 YDL152WYDL152W 366 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 YDR220CYDR220C 294 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 YDR521WYDR521W 336 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 PRM8YGL053W 714 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 SDS22YKL193C 1017 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 ZIP1YDR285W 2628 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 SWI5YDR146C 2130 nt0.64□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 YCS4YLR272C 3531 nt0.64□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.64□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 YGR228WYGR228W 345 nt0.64□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 RTT102YGR275W 474 nt0.64□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 YOP1YPR028W 543 nt0.64□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 YPR096CYPR096C 303 nt0.64□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 NUT1YGL151W 3399 nt0.63□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 SAS3YBL052C 2496 nt0.63□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 NOC3YLR002C 1992 nt0.63□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 SNO3YFL060C 669 nt0.63□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 YGL015CYGL015C 393 nt0.63□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 CMC4YMR194C-B 222 nt0.63□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 SNO2YNL334C 669 nt0.63□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 YCL002CYCL002C 792 nt0.63□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 UTP13YLR222C 2454 nt0.63□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 AIM9YER080W 1884 nt0.63□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 YCR100CYCR100C 951 nt0.62□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 GPM2YDL021W 936 nt0.62□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 RPC10YHR143W-A 213 nt0.62□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 YLR271WYLR271W 825 nt0.62□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 TOF2YKR010C 2316 nt0.62□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 MPT5YGL178W 2580 nt0.62□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 CDC24YAL041W 2565 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 HNT1YDL125C 477 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 SEM1YDR363W-A 270 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 QCR7YDR529C 384 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 CYC7YEL039C 342 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 YBR012CYBR012C 420 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 CLU1YMR012W 3834 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 YGR045CYGR045C 363 nt0.6□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 NUT2YPR168W 474 nt0.6□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.6□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 PIG1YLR273C 1947 nt0.6□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 SHE9YDR393W 1371 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 RPL16AYIL133C 600 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 YLR366WYLR366W 306 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 YPR099CYPR099C 357 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG41Q12048 PAN3YKL025C 2040 nt0.59□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 snR9snR9 187 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 YDR509WYDR509W 348 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 MND1YGL183C 660 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 YAL066WYAL066W 309 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 CSM4YPL200W 471 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 SET3YKR029C 2256 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 MKT1YNL085W 2493 nt0.57□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 AIM44YPL158C 2277 nt0.57□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.57□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 YAP3YHL009C 993 nt0.57□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 YMR254CYMR254C 309 nt0.57□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.57□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 RUF22RUF22 515 nt0.57□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.57□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 RIM20YOR275C 1986 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 YBR063CYBR063C 1215 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 NUP157YER105C 4176 nt0.56□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.1 ms