Protein–RNA interactions for Protein: Q12000

TMA46, Translation machinery-associated protein 46, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMA46Q12000 INA22YIR024C 651 nt2.79□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt2.79□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt2.79□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.79□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 YKU80YMR106C 1890 nt2.79□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 SET2YJL168C 2202 nt2.78□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 INP2YMR163C 2118 nt2.78□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 VIK1YPL253C 1944 nt2.78□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 MUK1YPL070W 1839 nt2.78□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 YDR286CYDR286C 345 nt2.78□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 PNC1YGL037C 651 nt2.78□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.78□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 FRE2YKL220C 2136 nt2.78□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 COS111YBR203W 2775 nt2.78□□□□□ -1.97
TMA46Q12000 YJL135WYJL135W 318 nt2.77□□□□□ -1.97
TMA46Q12000 YNL018CYNL018C 1839 nt2.77□□□□□ -1.97
TMA46Q12000 snR43snR43 209 nt2.76□□□□□ -1.97
TMA46Q12000 SWI6YLR182W 2412 nt2.76□□□□□ -1.97
TMA46Q12000 AXL1YPR122W 3627 nt2.75□□□□□ -1.97
TMA46Q12000 YGR151CYGR151C 336 nt2.75□□□□□ -1.97
TMA46Q12000 CAF120YNL278W 3183 nt2.75□□□□□ -1.97
TMA46Q12000 SLM1YIL105C 2061 nt2.75□□□□□ -1.97
TMA46Q12000 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt2.74□□□□□ -1.97
TMA46Q12000 YIL174WYIL174W 228 nt2.74□□□□□ -1.97
TMA46Q12000 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.74□□□□□ -1.97
TMA46Q12000 PTP3YER075C 2787 nt2.74□□□□□ -1.97
TMA46Q12000 RAX2YLR084C 3663 nt2.74□□□□□ -1.97
TMA46Q12000 MMS22YLR320W 4365 nt2.74□□□□□ -1.97
TMA46Q12000 PDE2YOR360C 1581 nt2.74□□□□□ -1.97
TMA46Q12000 RFX1YLR176C 2436 nt2.73□□□□□ -1.97
TMA46Q12000 YCR043CYCR043C 384 nt2.73□□□□□ -1.97
TMA46Q12000 SPT21YMR179W 2277 nt2.73□□□□□ -1.97
TMA46Q12000 BPT1YLL015W 4680 nt2.73□□□□□ -1.97
TMA46Q12000 SWI5YDR146C 2130 nt2.72□□□□□ -1.97
TMA46Q12000 ZRG8YER033C 3231 nt2.72□□□□□ -1.97
TMA46Q12000 YLR012CYLR012C 300 nt2.72□□□□□ -1.97
TMA46Q12000 MPT5YGL178W 2580 nt2.71□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 RSE1YML049C 4086 nt2.71□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 ESL2YKR096W 3588 nt2.71□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 snR72snR72 98 nt2.71□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 RPB10YOR210W 213 nt2.71□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 LCL1YPL056C 306 nt2.71□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt2.71□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 DYN1YKR054C 12279 nt2.7□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 LYS14YDR034C 2373 nt2.7□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 PAU8YAL068C 363 nt2.7□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 PAU18YLL064C 363 nt2.7□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 PAU6YNR076W 363 nt2.7□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 PAU20YOL161C 363 nt2.7□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 VPS54YDR027C 2670 nt2.69□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 Q0092Q0092 141 nt2.69□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.69□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 YOL160WYOL160W 342 nt2.69□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 UBR1YGR184C 5853 nt2.69□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 SWA2YDR320C 2007 nt2.68□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 TRS130YMR218C 3309 nt2.67□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 VTC3YPL019C 2508 nt2.67□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 MET18YIL128W 3099 nt2.67□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 VPS55YJR044C 423 nt2.67□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 APC9YLR102C 798 nt2.67□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 RRT15YLR162W-A 189 nt2.67□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 SLY1YDR189W 2001 nt2.67□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 NIP100YPL174C 2607 nt2.66□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 FAR11YNL127W 2862 nt2.66□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 RPS29AYLR388W 171 nt2.66□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 YCL046WYCL046W 324 nt2.66□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 RPA190YOR341W 4995 nt2.66□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 YPL150WYPL150W 2706 nt2.66□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 SRO77YBL106C 3033 nt2.66□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 MNE1YOR350C 1992 nt2.65□□□□□ -1.98
TMA46Q12000 EMP24YGL200C 612 nt2.65□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.65□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 YPR092WYPR092W 306 nt2.65□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 ESC1YMR219W 4977 nt2.64□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 TOP2YNL088W 4287 nt2.64□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 SPC98YNL126W 2541 nt2.64□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 DBP10YDL031W 2988 nt2.64□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 HYP2YEL034W 474 nt2.64□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 YJL150WYJL150W 303 nt2.64□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 COX14YML129C 213 nt2.64□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 YPR203WYPR203W 309 nt2.64□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 SRB8YCR081W 4284 nt2.64□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 NUP100YKL068W 2880 nt2.64□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 BCK1YJL095W 4437 nt2.63□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 YDR209CYDR209C 414 nt2.63□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 YER088C-AYER088C-A 324 nt2.63□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.63□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 TCB2YNL087W 3537 nt2.63□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 BUB1YGR188C 3066 nt2.63□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 JSN1YJR091C 3276 nt2.62□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 NUM1YDR150W 8247 nt2.62□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 VPS8YAL002W 3825 nt2.62□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 ISW1YBR245C 3390 nt2.61□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 snR74snR74 88 nt2.61□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 OLI1Q0130 231 nt2.61□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 KTI11YBL071W-A 249 nt2.61□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 YNL338WYNL338W 159 nt2.61□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 SEC26YDR238C 2922 nt2.61□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 ZRG17YNR039C 1818 nt2.61□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 YEL014CYEL014C 306 nt2.6□□□□□ -1.99
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