Protein–RNA interactions for Protein: Q08646

SSP2, Sporulation-specific protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSP2Q08646 RPA34YJL148W 702 nt2.12□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 MRPL50YNR022C 420 nt2.12□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 YOL159CYOL159C 516 nt2.12□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt2.12□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 CHC1YGL206C 4962 nt2.12□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 TDA9YML081W 3756 nt2.12□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 SBE22YHR103W 2559 nt2.11□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 CFT2YLR115W 2580 nt2.11□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 USO1YDL058W 5373 nt2.11□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 SEC63YOR254C 1992 nt2.11□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 CBS1YDL069C 690 nt2.11□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 YDR269CYDR269C 324 nt2.11□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.11□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 YHR138CYHR138C 345 nt2.11□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 YBL073WYBL073W 312 nt2.11□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 SEY1YOR165W 2331 nt2.11□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 BRR2YER172C 6492 nt2.1□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 FMP23YBR047W 528 nt2.1□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 YPL238CYPL238C 390 nt2.1□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 SWF1YDR126W 1011 nt2.09□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 YER088C-AYER088C-A 324 nt2.09□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 Q0142Q0142 177 nt2.09□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 RPS24BYIL069C 408 nt2.09□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 TMA7YLR262C-A 195 nt2.09□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 YOR146WYOR146W 306 nt2.09□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 YPL185WYPL185W 396 nt2.09□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 IRE1YHR079C 3348 nt2.09□□□□□ -2.07
SSP2Q08646 RTT102YGR275W 474 nt2.08□□□□□ -2.08
SSP2Q08646 RPL42BYHR141C 321 nt2.08□□□□□ -2.08
SSP2Q08646 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt2.08□□□□□ -2.08
SSP2Q08646 COA6YMR244C-A 315 nt2.08□□□□□ -2.08
SSP2Q08646 RPL42AYNL162W 321 nt2.08□□□□□ -2.08
SSP2Q08646 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt2.08□□□□□ -2.08
SSP2Q08646 YOR093CYOR093C 4947 nt2.07□□□□□ -2.08
SSP2Q08646 YNL114CYNL114C 372 nt2.07□□□□□ -2.08
SSP2Q08646 YBR285WYBR285W 435 nt2.07□□□□□ -2.08
SSP2Q08646 CTR9YOL145C 3234 nt2.07□□□□□ -2.08
SSP2Q08646 YDL011CYDL011C 324 nt2.06□□□□□ -2.08
SSP2Q08646 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt2.06□□□□□ -2.08
SSP2Q08646 RPS27AYKL156W 249 nt2.06□□□□□ -2.08
SSP2Q08646 YLR334CYLR334C 381 nt2.06□□□□□ -2.08
SSP2Q08646 YPR012WYPR012W 255 nt2.06□□□□□ -2.08
SSP2Q08646 YGR250CYGR250C 2346 nt2.06□□□□□ -2.08
SSP2Q08646 MYO2YOR326W 4725 nt2.05□□□□□ -2.08
SSP2Q08646 ELG1YOR144C 2376 nt2.05□□□□□ -2.08
SSP2Q08646 NOP14YDL148C 2433 nt2.05□□□□□ -2.08
SSP2Q08646 YLR434CYLR434C 384 nt2.05□□□□□ -2.08
SSP2Q08646 YHR210CYHR210C 1026 nt2.04□□□□□ -2.08
SSP2Q08646 YOR053WYOR053W 342 nt2.04□□□□□ -2.08
SSP2Q08646 YPL261CYPL261C 309 nt2.04□□□□□ -2.08
SSP2Q08646 AGC1YPR021C 2709 nt2.04□□□□□ -2.08
SSP2Q08646 DFG16YOR030W 1860 nt2.03□□□□□ -2.08
SSP2Q08646 DNF3YMR162C 4971 nt2.03□□□□□ -2.08
SSP2Q08646 PAU3YCR104W 375 nt2.03□□□□□ -2.08
SSP2Q08646 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt2.03□□□□□ -2.08
SSP2Q08646 CAT8YMR280C 4302 nt2.03□□□□□ -2.08
SSP2Q08646 MAK10YEL053C 2202 nt2.02□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 UBR2YLR024C 5619 nt2.02□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 YDR008CYDR008C 351 nt2.02□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 GIM4YEL003W 336 nt2.02□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 TIM13YGR181W 318 nt2.02□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt2.02□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.02□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 RPL9BYNL067W 576 nt2.02□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 RTP1YMR185W 2946 nt2.02□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 CHS1YNL192W 3396 nt2.02□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 FRK1YPL141C 2598 nt2.02□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 YJR039WYJR039W 3366 nt2.01□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 NOP53YPL146C 1368 nt2.01□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 YGR265WYGR265W 411 nt2.01□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 MSH6YDR097C 3729 nt2.01□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 HDA3YPR179C 1968 nt2.01□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 HMI1YOL095C 2121 nt2□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 MSC6YOR354C 2079 nt2□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt2□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt2□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 YAR047CYAR047C 321 nt2□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 BSC3YLR465C 309 nt2□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 HHT1YBR010W 411 nt2□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 SWI5YDR146C 2130 nt2□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 SWI6YLR182W 2412 nt1.99□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 MEC1YBR136W 7107 nt1.99□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 ABM1YJR108W 372 nt1.99□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 RLM1YPL089C 2031 nt1.98□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 MSH3YCR092C 3057 nt1.98□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 RPL32YBL092W 393 nt1.98□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 CDC31YOR257W 486 nt1.98□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 AIM9YER080W 1884 nt1.98□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 SAC3YDR159W 3906 nt1.98□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 WIP1YDR374W-A 270 nt1.97□□□□□ -2.09
SSP2Q08646 ZRG17YNR039C 1818 nt1.96□□□□□ -2.1
SSP2Q08646 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.96□□□□□ -2.1
SSP2Q08646 PHS1YJL097W 654 nt1.96□□□□□ -2.1
SSP2Q08646 PAU18YLL064C 363 nt1.96□□□□□ -2.1
SSP2Q08646 PAU6YNR076W 363 nt1.96□□□□□ -2.1
SSP2Q08646 OSH6YKR003W 1347 nt1.95□□□□□ -2.1
SSP2Q08646 ATG31YDR022C 591 nt1.95□□□□□ -2.1
SSP2Q08646 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt1.95□□□□□ -2.1
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