Protein–RNA interactions for Protein: Q08235

BRX1, Ribosome biogenesis protein BRX1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRX1Q08235 IRC23YOR044W 474 nt0.75□□□□□ -2.29
BRX1Q08235 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt0.74□□□□□ -2.29
BRX1Q08235 YOR029WYOR029W 336 nt0.74□□□□□ -2.29
BRX1Q08235 YBR012CYBR012C 420 nt0.74□□□□□ -2.29
BRX1Q08235 NUP157YER105C 4176 nt0.74□□□□□ -2.29
BRX1Q08235 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt0.73□□□□□ -2.29
BRX1Q08235 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt0.73□□□□□ -2.29
BRX1Q08235 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt0.73□□□□□ -2.29
BRX1Q08235 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.73□□□□□ -2.29
BRX1Q08235 YCL020WYCL020W 1317 nt0.73□□□□□ -2.29
BRX1Q08235 YGR045CYGR045C 363 nt0.73□□□□□ -2.29
BRX1Q08235 YPT6YLR262C 648 nt0.73□□□□□ -2.29
BRX1Q08235 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt0.73□□□□□ -2.29
BRX1Q08235 NOC3YLR002C 1992 nt0.73□□□□□ -2.29
BRX1Q08235 VPS52YDR484W 1926 nt0.73□□□□□ -2.29
BRX1Q08235 YDL073WYDL073W 2955 nt0.72□□□□□ -2.29
BRX1Q08235 YFR057WYFR057W 456 nt0.72□□□□□ -2.29
BRX1Q08235 ZIP1YDR285W 2628 nt0.72□□□□□ -2.29
BRX1Q08235 COG4YPR105C 2586 nt0.71□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 PRP16YKR086W 3216 nt0.71□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 YHR054CYHR054C 1065 nt0.71□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.71□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.71□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.71□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 TOF2YKR010C 2316 nt0.71□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 AIM44YPL158C 2277 nt0.71□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 MPT5YGL178W 2580 nt0.7□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 YDL152WYDL152W 366 nt0.7□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 TIM10YHR005C-A 282 nt0.7□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 YPL197CYPL197C 414 nt0.7□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 NUT2YPR168W 474 nt0.7□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 RIM20YOR275C 1986 nt0.69□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 UTP13YLR222C 2454 nt0.69□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 NHP2YDL208W 471 nt0.69□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.69□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 YPR170CYPR170C 336 nt0.69□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 BI4Q0120 1917 nt0.69□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 AIM9YER080W 1884 nt0.69□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 PAC1YOR269W 1485 nt0.68□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 GPM2YDL021W 936 nt0.68□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 snR79snR79 84 nt0.68□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 SEC1YDR164C 2175 nt0.68□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 YER138W-AYER138W-A 105 nt0.68□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 RPL16AYIL133C 600 nt0.68□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.68□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt0.68□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 YDR521WYDR521W 336 nt0.67□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 CYC7YEL039C 342 nt0.67□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 YGL109WYGL109W 324 nt0.67□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 YGL230CYGL230C 444 nt0.67□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.67□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.67□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 UBS1YBR165W 834 nt0.67□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.67□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 PIG1YLR273C 1947 nt0.67□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 SWI5YDR146C 2130 nt0.67□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.66□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt0.66□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 YGR115CYGR115C 780 nt0.66□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 YKL111CYKL111C 336 nt0.66□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 MRPS8YMR158W 468 nt0.66□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 CMC4YMR194C-B 222 nt0.66□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 YOP1YPR028W 543 nt0.66□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 POP7YBR167C 423 nt0.66□□□□□ -2.3
BRX1Q08235 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt0.65□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.65□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 RPS30BYOR182C 192 nt0.65□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 ALY2YJL084C 3141 nt0.64□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 YDR114CYDR114C 303 nt0.64□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 CWC23YGL128C 852 nt0.64□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 SLX9YGR081C 633 nt0.64□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.64□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 YOR199WYOR199W 330 nt0.64□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 SRP14YDL092W 441 nt0.63□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.63□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 LRP1YHR081W 555 nt0.63□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.63□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.63□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.63□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.63□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 COX7YMR256C 183 nt0.63□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt0.63□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.63□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 SET3YKR029C 2256 nt0.63□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 KAR1YNL188W 1302 nt0.63□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 YDL206WYDL206W 2289 nt0.62□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 YGL015CYGL015C 393 nt0.61□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 INA22YIR024C 651 nt0.61□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 SDS22YKL193C 1017 nt0.61□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 SPC2YML055W 537 nt0.61□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 RUF22RUF22 515 nt0.61□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 YBR071WYBR071W 636 nt0.61□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 YPR099CYPR099C 357 nt0.6□□□□□ -2.31
BRX1Q08235 OST1YJL002C 1431 nt0.6□□□□□ -2.31
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