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Protein–RNA interactions for Protein: Q03048
COF1, Cofilin, yeast
Known RBP
Predictions only
Length
143 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
COF1
Q03048
SNO2
YNL334C
669 nt
0.37
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
IES4
YOR189W
351 nt
0.37
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
LTE1
YAL024C
4308 nt
0.37
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
DAD1
YDR016C
285 nt
0.36
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
tT(AGU)B
tT(AGU)B
73 nt
0.36
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
tT(AGU)C
tT(AGU)C
73 nt
0.36
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
tT(AGU)D
tT(AGU)D
73 nt
0.36
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
tT(AGU)H
tT(AGU)H
73 nt
0.36
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
tT(AGU)I1
tT(AGU)I1
73 nt
0.36
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
tT(AGU)I2
tT(AGU)I2
73 nt
0.36
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
tT(AGU)J
tT(AGU)J
73 nt
0.36
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
tT(AGU)N1
tT(AGU)N1
73 nt
0.36
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
tT(AGU)N2
tT(AGU)N2
73 nt
0.36
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
tT(AGU)O1
tT(AGU)O1
73 nt
0.36
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
tT(AGU)O2
tT(AGU)O2
73 nt
0.36
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
YMR175W-A
YMR175W-A
195 nt
0.36
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
YOP1
YPR028W
543 nt
0.36
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
FIG4
YNL325C
2640 nt
0.36
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
PAC1
YOR269W
1485 nt
0.35
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
YML009C-A
YML009C-A
327 nt
0.35
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
RUF22
RUF22
515 nt
0.35
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
SPR2
YOR214C
711 nt
0.35
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
PXA2
YKL188C
2562 nt
0.35
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
SWI6
YLR182W
2412 nt
0.34
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
YDR003W-A
YDR003W-A
123 nt
0.34
□□□□□ -2.36
COF1
Q03048
OCA6
YDR067C
675 nt
0.34
□□□□□ -2.36
COF1
Q03048
YHR063W-A
YHR063W-A
336 nt
0.34
□□□□□ -2.36
COF1
Q03048
ARV1
YLR242C
966 nt
0.34
□□□□□ -2.36
COF1
Q03048
PDE2
YOR360C
1581 nt
0.34
□□□□□ -2.36
COF1
Q03048
YPL080C
YPL080C
327 nt
0.34
□□□□□ -2.36
COF1
Q03048
MKT1
YNL085W
2493 nt
0.33
□□□□□ -2.36
COF1
Q03048
YER038W-A
YER038W-A
381 nt
0.33
□□□□□ -2.36
COF1
Q03048
OST5
YGL226C-A
261 nt
0.33
□□□□□ -2.36
COF1
Q03048
YIL059C
YIL059C
366 nt
0.33
□□□□□ -2.36
COF1
Q03048
CMS1
YLR003C
876 nt
0.33
□□□□□ -2.36
COF1
Q03048
YPL119C-A
YPL119C-A
264 nt
0.33
□□□□□ -2.36
COF1
Q03048
PAN2
YGL094C
3348 nt
0.33
□□□□□ -2.36
COF1
Q03048
SWI5
YDR146C
2130 nt
0.32
□□□□□ -2.36
COF1
Q03048
SCW11
YGL028C
1629 nt
0.32
□□□□□ -2.36
COF1
Q03048
YHR028W-A
YHR028W-A
321 nt
0.32
□□□□□ -2.36
COF1
Q03048
DFG10
YIL049W
762 nt
0.32
□□□□□ -2.36
COF1
Q03048
YBR032W
YBR032W
303 nt
0.32
□□□□□ -2.36
COF1
Q03048
DBP6
YNR038W
1890 nt
0.32
□□□□□ -2.36
COF1
Q03048
MDM32
YOR147W
1869 nt
0.32
□□□□□ -2.36
COF1
Q03048
RPL22B
YFL034C-A
369 nt
0.31
□□□□□ -2.36
COF1
Q03048
RPL37A
YLR185W
267 nt
0.31
□□□□□ -2.36
COF1
Q03048
snR59
snR59
78 nt
0.3
□□□□□ -2.36
COF1
Q03048
IRC2
YDR112W
309 nt
0.3
□□□□□ -2.36
COF1
Q03048
ATP20
YPR020W
348 nt
0.3
□□□□□ -2.36
COF1
Q03048
UBP3
YER151C
2739 nt
0.3
□□□□□ -2.36
COF1
Q03048
SLD3
YGL113W
2007 nt
0.3
□□□□□ -2.36
COF1
Q03048
AI5_ALPHA
Q0070
1893 nt
0.29
□□□□□ -2.36
COF1
Q03048
ALY2
YJL084C
3141 nt
0.29
□□□□□ -2.36
COF1
Q03048
VPS52
YDR484W
1926 nt
0.28
□□□□□ -2.36
COF1
Q03048
YBL068W-A
YBL068W-A
237 nt
0.28
□□□□□ -2.36
COF1
Q03048
MMS4
YBR098W
2076 nt
0.27
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
HNT1
YDL125C
477 nt
0.27
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
YER087C-A
YER087C-A
552 nt
0.27
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
YIL142C-A
YIL142C-A
333 nt
0.27
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
YSP1
YHR155W
3687 nt
0.26
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
YDL152W
YDL152W
366 nt
0.26
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
YDR115W
YDR115W
318 nt
0.26
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
URM1
YIL008W
300 nt
0.26
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
ABF2
YMR072W
552 nt
0.26
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
YOR364W
YOR364W
369 nt
0.26
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
KAR1
YNL188W
1302 nt
0.26
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
APL2
YKL135C
2181 nt
0.26
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
snR79
snR79
84 nt
0.25
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
ISD11
YER048W-A
285 nt
0.25
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
YGR270C-A
YGR270C-A
219 nt
0.25
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
WAR1
YML076C
2835 nt
0.24
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
SRB7
YDR308C
423 nt
0.24
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
SDH2
YLL041C
801 nt
0.24
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
SPC2
YML055W
537 nt
0.24
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
YOR072W-A
YOR072W-A
249 nt
0.24
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
SLY1
YDR189W
2001 nt
0.24
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
OST1
YJL002C
1431 nt
0.23
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
LYS14
YDR034C
2373 nt
0.23
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
YDR114C
YDR114C
303 nt
0.23
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
PRE4
YFR050C
801 nt
0.23
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
YHR050W-A
YHR050W-A
171 nt
0.23
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
YOR029W
YOR029W
336 nt
0.23
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
YMR160W
YMR160W
2451 nt
0.23
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
LOC1
YFR001W
615 nt
0.22
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
COX3
Q0275
810 nt
0.22
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
GMC2
YLR445W
567 nt
0.22
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
COX7
YMR256C
183 nt
0.22
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
YPR153W
YPR153W
423 nt
0.22
□□□□□ -2.37
COF1
Q03048
YAR009C
YAR009C
3591 nt
0.21
□□□□□ -2.38
COF1
Q03048
LCD1
YDR499W
2244 nt
0.21
□□□□□ -2.38
COF1
Q03048
BFR2
YDR299W
1605 nt
0.21
□□□□□ -2.38
COF1
Q03048
YHR139C-A
YHR139C-A
312 nt
0.21
□□□□□ -2.38
COF1
Q03048
tT(UGU)Q1
tT(UGU)Q1
76 nt
0.21
□□□□□ -2.38
COF1
Q03048
YPR170C
YPR170C
336 nt
0.21
□□□□□ -2.38
COF1
Q03048
GEA2
YEL022W
4380 nt
0.21
□□□□□ -2.38
COF1
Q03048
YER023C-A
YER023C-A
213 nt
0.2
□□□□□ -2.38
COF1
Q03048
TDA2
YER071C
381 nt
0.2
□□□□□ -2.38
COF1
Q03048
INA22
YIR024C
651 nt
0.2
□□□□□ -2.38
COF1
Q03048
HIT1
YJR055W
495 nt
0.2
□□□□□ -2.38
COF1
Q03048
ACF4
YJR083C
930 nt
0.2
□□□□□ -2.38
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