Protein–RNA interactions for Protein: Q01589

SED1, Cell wall protein SED1, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SED1Q01589 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SED1Q01589 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SED1Q01589 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SED1Q01589 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SED1Q01589 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SED1Q01589 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SED1Q01589 COX3Q0275 810 nt0.59□□□□□ -2.31
SED1Q01589 YIR020CYIR020C 303 nt0.59□□□□□ -2.31
SED1Q01589 TIM8YJR135W-A 264 nt0.59□□□□□ -2.31
SED1Q01589 SGO1YOR073W 1773 nt0.59□□□□□ -2.32
SED1Q01589 SAS3YBL052C 2496 nt0.59□□□□□ -2.32
SED1Q01589 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt0.59□□□□□ -2.32
SED1Q01589 KAR3YPR141C 2190 nt0.59□□□□□ -2.32
SED1Q01589 APL3YBL037W 3078 nt0.58□□□□□ -2.32
SED1Q01589 MPC1YGL080W 393 nt0.58□□□□□ -2.32
SED1Q01589 CRG1YHR209W 876 nt0.58□□□□□ -2.32
SED1Q01589 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt0.58□□□□□ -2.32
SED1Q01589 DDR48YMR173W 1293 nt0.58□□□□□ -2.32
SED1Q01589 YBL073WYBL073W 312 nt0.58□□□□□ -2.32
SED1Q01589 IRC23YOR044W 474 nt0.58□□□□□ -2.32
SED1Q01589 YCL046WYCL046W 324 nt0.58□□□□□ -2.32
SED1Q01589 REF2YDR195W 1602 nt0.57□□□□□ -2.32
SED1Q01589 YLL054CYLL054C 2532 nt0.57□□□□□ -2.32
SED1Q01589 IES5YER092W 378 nt0.57□□□□□ -2.32
SED1Q01589 YFR057WYFR057W 456 nt0.57□□□□□ -2.32
SED1Q01589 DFG10YIL049W 762 nt0.57□□□□□ -2.32
SED1Q01589 ACF4YJR083C 930 nt0.57□□□□□ -2.32
SED1Q01589 CMS1YLR003C 876 nt0.57□□□□□ -2.32
SED1Q01589 SMD3YLR147C 306 nt0.57□□□□□ -2.32
SED1Q01589 YLR217WYLR217W 324 nt0.57□□□□□ -2.32
SED1Q01589 RPL9BYNL067W 576 nt0.57□□□□□ -2.32
SED1Q01589 YPL080CYPL080C 327 nt0.57□□□□□ -2.32
SED1Q01589 SAG1YJR004C 1953 nt0.56□□□□□ -2.32
SED1Q01589 SPT21YMR179W 2277 nt0.56□□□□□ -2.32
SED1Q01589 YCR100CYCR100C 951 nt0.56□□□□□ -2.32
SED1Q01589 SEM1YDR363W-A 270 nt0.56□□□□□ -2.32
SED1Q01589 CHZ1YER030W 462 nt0.56□□□□□ -2.32
SED1Q01589 YER038W-AYER038W-A 381 nt0.56□□□□□ -2.32
SED1Q01589 TDA2YER071C 381 nt0.56□□□□□ -2.32
SED1Q01589 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.56□□□□□ -2.32
SED1Q01589 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.56□□□□□ -2.32
SED1Q01589 ARV1YLR242C 966 nt0.56□□□□□ -2.32
SED1Q01589 MRPS8YMR158W 468 nt0.56□□□□□ -2.32
SED1Q01589 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt0.56□□□□□ -2.32
SED1Q01589 YPR172WYPR172W 603 nt0.56□□□□□ -2.32
SED1Q01589 YBR184WYBR184W 1572 nt0.55□□□□□ -2.32
SED1Q01589 URM1YIL008W 300 nt0.55□□□□□ -2.32
SED1Q01589 YPR170CYPR170C 336 nt0.55□□□□□ -2.32
SED1Q01589 GDS1YOR355W 1569 nt0.54□□□□□ -2.32
SED1Q01589 NUT1YGL151W 3399 nt0.54□□□□□ -2.32
SED1Q01589 RPL42BYHR141C 321 nt0.54□□□□□ -2.32
SED1Q01589 LIN1YHR156C 1023 nt0.54□□□□□ -2.32
SED1Q01589 SWS2YNL081C 432 nt0.54□□□□□ -2.32
SED1Q01589 RPL42AYNL162W 321 nt0.54□□□□□ -2.32
SED1Q01589 YOL106WYOL106W 354 nt0.54□□□□□ -2.32
SED1Q01589 AIM9YER080W 1884 nt0.53□□□□□ -2.32
SED1Q01589 YBR063CYBR063C 1215 nt0.53□□□□□ -2.32
SED1Q01589 YDL073WYDL073W 2955 nt0.52□□□□□ -2.33
SED1Q01589 PRM8YGL053W 714 nt0.52□□□□□ -2.33
SED1Q01589 RSM27YGR215W 333 nt0.52□□□□□ -2.33
SED1Q01589 YHR054CYHR054C 1065 nt0.52□□□□□ -2.33
SED1Q01589 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.52□□□□□ -2.33
SED1Q01589 YOR364WYOR364W 369 nt0.52□□□□□ -2.33
SED1Q01589 ATP20YPR020W 348 nt0.52□□□□□ -2.33
SED1Q01589 snR5snR5 204 nt0.51□□□□□ -2.33
SED1Q01589 CYC7YEL039C 342 nt0.51□□□□□ -2.33
SED1Q01589 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt0.51□□□□□ -2.33
SED1Q01589 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt0.51□□□□□ -2.33
SED1Q01589 MYO1YHR023W 5787 nt0.51□□□□□ -2.33
SED1Q01589 NBL1YHR199C-A 222 nt0.51□□□□□ -2.33
SED1Q01589 SET3YKR029C 2256 nt0.51□□□□□ -2.33
SED1Q01589 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt0.51□□□□□ -2.33
SED1Q01589 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt0.51□□□□□ -2.33
SED1Q01589 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.51□□□□□ -2.33
SED1Q01589 YCL020WYCL020W 1317 nt0.51□□□□□ -2.33
SED1Q01589 YGL230CYGL230C 444 nt0.5□□□□□ -2.33
SED1Q01589 YAP3YHL009C 993 nt0.5□□□□□ -2.33
SED1Q01589 SPO13YHR014W 876 nt0.5□□□□□ -2.33
SED1Q01589 YAL066WYAL066W 309 nt0.5□□□□□ -2.33
SED1Q01589 RPL37AYLR185W 267 nt0.5□□□□□ -2.33
SED1Q01589 NBP1YLR457C 960 nt0.5□□□□□ -2.33
SED1Q01589 YNL150WYNL150W 408 nt0.5□□□□□ -2.33
SED1Q01589 YOL014WYOL014W 375 nt0.5□□□□□ -2.33
SED1Q01589 POP7YBR167C 423 nt0.5□□□□□ -2.33
SED1Q01589 HDA3YPR179C 1968 nt0.5□□□□□ -2.33
SED1Q01589 VPS52YDR484W 1926 nt0.5□□□□□ -2.33
SED1Q01589 RRI2YOL117W 1938 nt0.49□□□□□ -2.33
SED1Q01589 YGR045CYGR045C 363 nt0.49□□□□□ -2.33
SED1Q01589 YGR115CYGR115C 780 nt0.49□□□□□ -2.33
SED1Q01589 LRP1YHR081W 555 nt0.49□□□□□ -2.33
SED1Q01589 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.49□□□□□ -2.33
SED1Q01589 YMR254CYMR254C 309 nt0.49□□□□□ -2.33
SED1Q01589 COX7YMR256C 183 nt0.49□□□□□ -2.33
SED1Q01589 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.49□□□□□ -2.33
SED1Q01589 YNL050CYNL050C 813 nt0.49□□□□□ -2.33
SED1Q01589 YBR012CYBR012C 420 nt0.49□□□□□ -2.33
SED1Q01589 YOR218CYOR218C 420 nt0.49□□□□□ -2.33
SED1Q01589 TOF2YKR010C 2316 nt0.49□□□□□ -2.33
SED1Q01589 UTP13YLR222C 2454 nt0.48□□□□□ -2.33
SED1Q01589 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.48□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 445.4 ms