Protein–RNA interactions for Protein: P55268

LAMB2, Laminin subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB2P55268 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMB2P55268 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMB2P55268 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms