Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KPNA2P52292 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms