Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TNIKQ9UKE5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TNIKQ9UKE5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TNIKQ9UKE5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TNIKQ9UKE5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TNIKQ9UKE5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TNIKQ9UKE5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TNIKQ9UKE5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TNIKQ9UKE5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TNIKQ9UKE5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TNIKQ9UKE5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
TNIKQ9UKE5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TNIKQ9UKE5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TNIKQ9UKE5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TNIKQ9UKE5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TNIKQ9UKE5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms