Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNE4Q8N205 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNE4Q8N205 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNE4Q8N205 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNE4Q8N205 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNE4Q8N205 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNE4Q8N205 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNE4Q8N205 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms