Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 295.8 ms