Protein–RNA interactions for Protein: P53152

MMS2, Ubiquitin-conjugating enzyme variant MMS2, yeastyeast

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MMS2P53152 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt0.94□□□□□ -2.26
MMS2P53152 YGL217CYGL217C 342 nt0.94□□□□□ -2.26
MMS2P53152 MRPS8YMR158W 468 nt0.94□□□□□ -2.26
MMS2P53152 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt0.94□□□□□ -2.26
MMS2P53152 YPL039WYPL039W 951 nt0.94□□□□□ -2.26
MMS2P53152 ATP20YPR020W 348 nt0.94□□□□□ -2.26
MMS2P53152 SLX4YLR135W 2247 nt0.93□□□□□ -2.26
MMS2P53152 GNT1YOR320C 1476 nt0.93□□□□□ -2.26
MMS2P53152 RAD50YNL250W 3939 nt0.93□□□□□ -2.26
MMS2P53152 SWI4YER111C 3282 nt0.93□□□□□ -2.26
MMS2P53152 YLL054CYLL054C 2532 nt0.92□□□□□ -2.26
MMS2P53152 CDC25YLR310C 4770 nt0.92□□□□□ -2.26
MMS2P53152 PHR1YOR386W 1698 nt0.92□□□□□ -2.26
MMS2P53152 RTR1YER139C 681 nt0.92□□□□□ -2.26
MMS2P53152 CWC23YGL128C 852 nt0.92□□□□□ -2.26
MMS2P53152 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.92□□□□□ -2.26
MMS2P53152 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.92□□□□□ -2.26
MMS2P53152 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
MMS2P53152 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.92□□□□□ -2.26
MMS2P53152 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
MMS2P53152 VAM6YDL077C 3150 nt0.92□□□□□ -2.26
MMS2P53152 SGO1YOR073W 1773 nt0.91□□□□□ -2.26
MMS2P53152 VPS54YDR027C 2670 nt0.91□□□□□ -2.26
MMS2P53152 MRPL32YCR003W 552 nt0.91□□□□□ -2.26
MMS2P53152 CHZ1YER030W 462 nt0.91□□□□□ -2.26
MMS2P53152 YPT6YLR262C 648 nt0.91□□□□□ -2.26
MMS2P53152 SPC2YML055W 537 nt0.91□□□□□ -2.26
MMS2P53152 YPR170CYPR170C 336 nt0.91□□□□□ -2.26
MMS2P53152 MPC1YGL080W 393 nt0.9□□□□□ -2.27
MMS2P53152 YGR283CYGR283C 1026 nt0.9□□□□□ -2.27
MMS2P53152 YCL046WYCL046W 324 nt0.9□□□□□ -2.27
MMS2P53152 EAF1YDR359C 2949 nt0.9□□□□□ -2.27
MMS2P53152 VPS52YDR484W 1926 nt0.89□□□□□ -2.27
MMS2P53152 YDL041WYDL041W 354 nt0.89□□□□□ -2.27
MMS2P53152 snR83snR83 306 nt0.89□□□□□ -2.27
MMS2P53152 YGL230CYGL230C 444 nt0.89□□□□□ -2.27
MMS2P53152 RPL42BYHR141C 321 nt0.89□□□□□ -2.27
MMS2P53152 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt0.89□□□□□ -2.27
MMS2P53152 RPL9BYNL067W 576 nt0.89□□□□□ -2.27
MMS2P53152 NOP15YNL110C 663 nt0.89□□□□□ -2.27
MMS2P53152 RPL42AYNL162W 321 nt0.89□□□□□ -2.27
MMS2P53152 YPR147CYPR147C 915 nt0.89□□□□□ -2.27
MMS2P53152 STB6YKL072W 2301 nt0.88□□□□□ -2.27
MMS2P53152 ZRG17YNR039C 1818 nt0.88□□□□□ -2.27
MMS2P53152 SMB1YER029C 591 nt0.88□□□□□ -2.27
MMS2P53152 YHR054CYHR054C 1065 nt0.88□□□□□ -2.27
MMS2P53152 PAU18YLL064C 363 nt0.88□□□□□ -2.27
MMS2P53152 DDR48YMR173W 1293 nt0.88□□□□□ -2.27
MMS2P53152 PAU6YNR076W 363 nt0.88□□□□□ -2.27
MMS2P53152 VAM3YOR106W 852 nt0.88□□□□□ -2.27
MMS2P53152 POP7YBR167C 423 nt0.88□□□□□ -2.27
MMS2P53152 DCP2YNL118C 2913 nt0.88□□□□□ -2.27
MMS2P53152 SPC98YNL126W 2541 nt0.87□□□□□ -2.27
MMS2P53152 KAP120YPL125W 3099 nt0.87□□□□□ -2.27
MMS2P53152 YGR115CYGR115C 780 nt0.87□□□□□ -2.27
MMS2P53152 RPL34BYIL052C 366 nt0.87□□□□□ -2.27
MMS2P53152 PKR1YMR123W 369 nt0.87□□□□□ -2.27
MMS2P53152 BUD3YCL014W 4911 nt0.87□□□□□ -2.27
MMS2P53152 YGR130CYGR130C 2451 nt0.86□□□□□ -2.27
MMS2P53152 PAU2YEL049W 363 nt0.86□□□□□ -2.27
MMS2P53152 YGL109WYGL109W 324 nt0.86□□□□□ -2.27
MMS2P53152 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.86□□□□□ -2.27
MMS2P53152 SEC28YIL076W 891 nt0.86□□□□□ -2.27
MMS2P53152 YIR020CYIR020C 303 nt0.86□□□□□ -2.27
MMS2P53152 NBP1YLR457C 960 nt0.86□□□□□ -2.27
MMS2P53152 YNL114CYNL114C 372 nt0.86□□□□□ -2.27
MMS2P53152 YJR029WYJR029W 5268 nt0.86□□□□□ -2.27
MMS2P53152 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.86□□□□□ -2.27
MMS2P53152 NUT1YGL151W 3399 nt0.86□□□□□ -2.27
MMS2P53152 SPT21YMR179W 2277 nt0.86□□□□□ -2.27
MMS2P53152 NUP145YGL092W 3954 nt0.86□□□□□ -2.27
MMS2P53152 PIP2YOR363C 2991 nt0.85□□□□□ -2.27
MMS2P53152 HDA3YPR179C 1968 nt0.85□□□□□ -2.27
MMS2P53152 MSH3YCR092C 3057 nt0.85□□□□□ -2.27
MMS2P53152 TIM10YHR005C-A 282 nt0.85□□□□□ -2.27
MMS2P53152 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.85□□□□□ -2.27
MMS2P53152 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.85□□□□□ -2.27
MMS2P53152 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt0.85□□□□□ -2.27
MMS2P53152 APL3YBL037W 3078 nt0.85□□□□□ -2.27
MMS2P53152 GDS1YOR355W 1569 nt0.85□□□□□ -2.27
MMS2P53152 BI4Q0120 1917 nt0.85□□□□□ -2.27
MMS2P53152 snR79snR79 84 nt0.84□□□□□ -2.27
MMS2P53152 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt0.84□□□□□ -2.27
MMS2P53152 YER121WYER121W 345 nt0.84□□□□□ -2.27
MMS2P53152 PRM8YGL053W 714 nt0.84□□□□□ -2.27
MMS2P53152 YML003WYML003W 873 nt0.84□□□□□ -2.27
MMS2P53152 YPL197CYPL197C 414 nt0.84□□□□□ -2.27
MMS2P53152 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt0.84□□□□□ -2.28
MMS2P53152 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt0.84□□□□□ -2.28
MMS2P53152 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt0.84□□□□□ -2.28
MMS2P53152 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt0.84□□□□□ -2.28
MMS2P53152 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.84□□□□□ -2.28
MMS2P53152 YCL020WYCL020W 1317 nt0.84□□□□□ -2.28
MMS2P53152 CDC39YCR093W 6327 nt0.84□□□□□ -2.28
MMS2P53152 YDL152WYDL152W 366 nt0.83□□□□□ -2.28
MMS2P53152 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.83□□□□□ -2.28
MMS2P53152 SNO3YFL060C 669 nt0.83□□□□□ -2.28
MMS2P53152 SNO2YNL334C 669 nt0.83□□□□□ -2.28
MMS2P53152 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt0.83□□□□□ -2.28
MMS2P53152 RPL33BYOR234C 324 nt0.83□□□□□ -2.28
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