Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM106CQ9BVX2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms