Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q546

HUB1, Ubiquitin-like modifier HUB1, yeast

Predictions only

Length 73 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HUB1	Q6Q546	RSM28	YDR494W	1086 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
HUB1	Q6Q546	YGR053C	YGR053C	852 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
HUB1	Q6Q546	PRS3	YHL011C	963 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
HUB1	Q6Q546	YHR063W-A	YHR063W-A	336 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
HUB1	Q6Q546	ATG17	YLR423C	1254 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
HUB1	Q6Q546	SLM6	YBR266C	453 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
HUB1	Q6Q546	MRPL27	YBR282W	441 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
HUB1	Q6Q546	SEC8	YPR055W	3198 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
HUB1	Q6Q546	MDM36	YPR083W	1740 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
HUB1	Q6Q546	SWI5	YDR146C	2130 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
HUB1	Q6Q546	YEL028W	YEL028W	462 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
HUB1	Q6Q546	SBH1	YER087C-B	249 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
HUB1	Q6Q546	LAG1	YHL003C	1236 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
HUB1	Q6Q546	MRPL50	YNR022C	420 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
HUB1	Q6Q546	YOR108C-A	YOR108C-A	210 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
HUB1	Q6Q546	MRPL40	YPL173W	894 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
HUB1	Q6Q546	snR190	snR190	190 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
HUB1	Q6Q546	AI3	Q0060	1248 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	HYM1	YKL189W	1200 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	YDL025W-A	YDL025W-A	105 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	YDR199W	YDR199W	366 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	VPS74	YDR372C	1038 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	YLR232W	YLR232W	348 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	RPL9B	YNL067W	576 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	MIX23	YBL107C	591 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	IES4	YOR189W	351 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	NTC20	YBR188C	423 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	RRP7	YCL031C	894 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	NUR1	YDL089W	1455 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	YGL039W	YGL039W	1047 nt		-0.18	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	EAF7	YNL136W	1278 nt		-0.18	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	YBR221W-A	YBR221W-A	105 nt		-0.18	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	APL2	YKL135C	2181 nt		-0.18	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	AI1	Q0050	2505 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	ALG13	YGL047W	609 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	YLR042C	YLR042C	486 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	BET5	YML077W	480 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	RCN2	YOR220W	798 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	YPR153W	YPR153W	423 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	NGG1	YDR176W	2109 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	YHL002C-A	YHL002C-A	489 nt		-0.2	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	YIL134C-A	YIL134C-A	204 nt		-0.2	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	YKL145W-A	YKL145W-A	93 nt		-0.2	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	YLR031W	YLR031W	561 nt		-0.2	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	YPD1	YDL235C	504 nt		-0.21	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	YEL030C-A	YEL030C-A	315 nt		-0.21	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	PRE4	YFR050C	801 nt		-0.21	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	IMP3	YHR148W	552 nt		-0.21	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	YAL064W	YAL064W	285 nt		-0.21	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	YIM2	YMR151W	438 nt		-0.21	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	YBR012C	YBR012C	420 nt		-0.21	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	YBP2	YGL060W	1926 nt		-0.22	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	MFA1	YDR461W	111 nt		-0.22	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	DLT1	YMR126C	1029 nt		-0.22	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	LOA1	YPR139C	903 nt		-0.22	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	STE5	YDR103W	2754 nt		-0.22	□□□□□ -2.44
HUB1	Q6Q546	YCR043C	YCR043C	384 nt		-0.23	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	ANS1	YHR126C	480 nt		-0.23	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	YOR199W	YOR199W	330 nt		-0.23	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	YBR200W-A	YBR200W-A	165 nt		-0.23	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	OSH6	YKR003W	1347 nt		-0.23	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	DPB11	YJL090C	2295 nt		-0.24	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	MKT1	YNL085W	2493 nt		-0.24	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	COG7	YGL005C	840 nt		-0.24	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	RPC25	YKL144C	639 nt		-0.24	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	YOL050C	YOL050C	321 nt		-0.24	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	ECM25	YJL201W	1800 nt		-0.24	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	snR68	snR68	136 nt		-0.25	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	RMD5	YDR255C	1266 nt		-0.25	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	YGR045C	YGR045C	363 nt		-0.25	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	HTD2	YHR067W	843 nt		-0.25	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	COG8	YML071C	1824 nt		-0.25	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	SLS1	YLR139C	1932 nt		-0.25	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	HIT1	YJR055W	495 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	SKG1	YKR100C	1068 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	ECI1	YLR284C	843 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	YMR173W-A	YMR173W-A	1185 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	DDR48	YMR173W	1293 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	NUT1	YGL151W	3399 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	RPL35B	YDL136W	363 nt		-0.27	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	RPL35A	YDL191W	363 nt		-0.27	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	TMA20	YER007C-A	546 nt		-0.27	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	YER091C-A	YER091C-A	222 nt		-0.27	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	ULI1	YFR026C	510 nt		-0.27	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	SMD3	YLR147C	306 nt		-0.27	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	FUS2	YMR232W	2034 nt		-0.27	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	DBP6	YNR038W	1890 nt		-0.27	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	OCA6	YDR067C	675 nt		-0.28	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	RPL26B	YGR034W	384 nt		-0.28	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	TIM8	YJR135W-A	264 nt		-0.28	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	RAM2	YKL019W	951 nt		-0.28	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	YOR029W	YOR029W	336 nt		-0.28	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	TRS20	YBR254C	528 nt		-0.28	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	CHS6	YJL099W	2241 nt		-0.28	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	YJR003C	YJR003C	1560 nt		-0.28	□□□□□ -2.45
HUB1	Q6Q546	MET32	YDR253C	576 nt		-0.29	□□□□□ -2.46
HUB1	Q6Q546	YBL083C	YBL083C	426 nt		-0.29	□□□□□ -2.46
HUB1	Q6Q546	SFG1	YOR315W	1041 nt		-0.29	□□□□□ -2.46
HUB1	Q6Q546	YDR003W-A	YDR003W-A	123 nt		-0.3	□□□□□ -2.46
HUB1	Q6Q546	RPL9A	YGL147C	576 nt		-0.3	□□□□□ -2.46

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