Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC93Q567U6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC93Q567U6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms