Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms