Protein–RNA interactions for Protein: P38235

YBR053C, Uncharacterized protein YBR053C, yeast

Predictions only

Length 358 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YBR053C	P38235	PUF6	YDR496C	1971 nt		2.79	□□□□□ -1.96
YBR053C	P38235	PSO2	YMR137C	1986 nt		2.79	□□□□□ -1.96
YBR053C	P38235	YPL150W	YPL150W	2706 nt		2.79	□□□□□ -1.96
YBR053C	P38235	TRM2	YKR056W	1920 nt		2.78	□□□□□ -1.96
YBR053C	P38235	POM152	YMR129W	4014 nt		2.78	□□□□□ -1.96
YBR053C	P38235	YDL242W	YDL242W	354 nt		2.78	□□□□□ -1.96
YBR053C	P38235	LSO2	YGR169C-A	279 nt		2.78	□□□□□ -1.96
YBR053C	P38235	YHL042W	YHL042W	453 nt		2.78	□□□□□ -1.96
YBR053C	P38235	tW(CCA)G1	tW(CCA)G1	72 nt		2.78	□□□□□ -1.96
YBR053C	P38235	tW(CCA)G2	tW(CCA)G2	72 nt		2.78	□□□□□ -1.96
YBR053C	P38235	tW(CCA)J	tW(CCA)J	72 nt		2.78	□□□□□ -1.96
YBR053C	P38235	tW(CCA)K	tW(CCA)K	72 nt		2.78	□□□□□ -1.96
YBR053C	P38235	tW(CCA)M	tW(CCA)M	72 nt		2.78	□□□□□ -1.96
YBR053C	P38235	tW(CCA)P	tW(CCA)P	72 nt		2.78	□□□□□ -1.96
YBR053C	P38235	RPA34	YJL148W	702 nt		2.78	□□□□□ -1.96
YBR053C	P38235	PFD1	YJL179W	330 nt		2.78	□□□□□ -1.96
YBR053C	P38235	YPP1	YGR198W	2454 nt		2.78	□□□□□ -1.96
YBR053C	P38235	DNA2	YHR164C	4569 nt		2.78	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	TFC4	YGR047C	3078 nt		2.77	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	KAR3	YPR141C	2190 nt		2.77	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	RAD5	YLR032W	3510 nt		2.77	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	YBL008W-A	YBL008W-A	240 nt		2.77	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	SAR1	YPL218W	573 nt		2.77	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	COG8	YML071C	1824 nt		2.77	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	BAS1	YKR099W	2436 nt		2.77	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	BPT1	YLL015W	4680 nt		2.77	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	RSE1	YML049C	4086 nt		2.76	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	YGR067C	YGR067C	2415 nt		2.76	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	snR55	snR55	98 nt		2.76	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	RBK1	YCR036W	1002 nt		2.76	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	YHL041W	YHL041W	450 nt		2.76	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	YLR053C	YLR053C	327 nt		2.76	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	CDC20	YGL116W	1833 nt		2.75	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	PUF4	YGL014W	2667 nt		2.75	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	QCR7	YDR529C	384 nt		2.75	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	RPL36A	YMR194W	303 nt		2.75	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	MRPL33	YMR286W	261 nt		2.75	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	YOR011W-A	YOR011W-A	207 nt		2.75	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	ASG1	YIL130W	2895 nt		2.75	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	DUF1	YOL087C	3351 nt		2.74	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	YOL057W	YOL057W	2136 nt		2.74	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	MAK21	YDR060W	3078 nt		2.74	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	YGL024W	YGL024W	336 nt		2.74	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	PHS1	YJL097W	654 nt		2.74	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	RIF1	YBR275C	5751 nt		2.74	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	GIN4	YDR507C	3429 nt		2.74	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	BUB1	YGR188C	3066 nt		2.73	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	IKI3	YLR384C	4050 nt		2.73	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	TFC1	YBR123C	1950 nt		2.72	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	DIS3	YOL021C	3006 nt		2.72	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	snR70	snR70	164 nt		2.72	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	DOT6	YER088C	2013 nt		2.72	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	YIL059C	YIL059C	366 nt		2.72	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	YLR154C-H	YLR154C-H	132 nt		2.72	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	YLR156C-A	YLR156C-A	132 nt		2.72	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	YLR157C-C	YLR157C-C	132 nt		2.72	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	YLR159C-A	YLR159C-A	132 nt		2.72	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	YBR197C	YBR197C	654 nt		2.72	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	NFT1	YKR103W	3657 nt		2.72	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	AXL1	YPR122W	3627 nt		2.72	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	SNU114	YKL173W	3027 nt		2.71	□□□□□ -1.97
YBR053C	P38235	YGL014C-A	YGL014C-A	162 nt		2.71	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	YMR230W-A	YMR230W-A	189 nt		2.71	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	NAB3	YPL190C	2409 nt		2.71	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	YAT2	YER024W	2772 nt		2.71	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	KAP104	YBR017C	2757 nt		2.71	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	ENA5	YDR038C	3276 nt		2.71	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	YDL185C-A	YDL185C-A	228 nt		2.7	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	ATP8	Q0080	147 nt		2.7	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	YIL174W	YIL174W	228 nt		2.7	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	RPS22A	YJL190C	393 nt		2.7	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	YJL222W-A	YJL222W-A	228 nt		2.7	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	YNL338W	YNL338W	159 nt		2.7	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	NPR3	YHL023C	3441 nt		2.7	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	PSY2	YNL201C	2577 nt		2.7	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	BCK1	YJL095W	4437 nt		2.7	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	SLN1	YIL147C	3663 nt		2.7	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	SNQ2	YDR011W	4506 nt		2.69	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	snR60	snR60	104 nt		2.69	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	GPG1	YGL121C	381 nt		2.69	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	YLR154W-E	YLR154W-E	204 nt		2.69	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	RTC6	YPL183W-A	282 nt		2.69	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	snR43	snR43	209 nt		2.69	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	MVP1	YMR004W	1536 nt		2.68	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	NPR2	YEL062W	1848 nt		2.68	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	YDL025W-A	YDL025W-A	105 nt		2.68	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	CYB5	YNL111C	363 nt		2.68	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	HHT1	YBR010W	411 nt		2.68	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	DFG16	YOR030W	1860 nt		2.68	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	RLI1	YDR091C	1827 nt		2.68	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	NEW1	YPL226W	3591 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	SOK2	YMR016C	2358 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	HDA3	YPR179C	1968 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	IPT1	YDR072C	1584 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	NPC2	YDL046W	522 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	snR76	snR76	109 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	YHR032W-A	YHR032W-A	180 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	YPR063C	YPR063C	423 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	YLR278C	YLR278C	4026 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YBR053C	P38235	YGR250C	YGR250C	2346 nt		2.67	□□□□□ -1.98

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 84.6 ms