Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM106CQ9BVX2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms