Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
EEA1Q15075 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC33.39■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
EEA1Q15075 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
EEA1Q15075 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms