Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 TRM7YBR061C 933 nt2.64□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 MSS11YMR164C 2277 nt2.64□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 ECM29YHL030W 5607 nt2.64□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 DSE4YNR067C 3354 nt2.63□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 YDL041WYDL041W 354 nt2.63□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 EMC6YLL014W 327 nt2.63□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 YLR031WYLR031W 561 nt2.63□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 YPL238CYPL238C 390 nt2.63□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 MGR1YCL044C 1254 nt2.63□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 PSK1YAL017W 4071 nt2.63□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 YJL181WYJL181W 1836 nt2.63□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 NPR3YHL023C 3441 nt2.62□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 SMC6YLR383W 3345 nt2.62□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 INO80YGL150C 4470 nt2.62□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 PSO2YMR137C 1986 nt2.62□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 YDR008CYDR008C 351 nt2.62□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.62□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 SEC7YDR170C 6030 nt2.62□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 YDR186CYDR186C 2634 nt2.62□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 RGR1YLR071C 3249 nt2.62□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 PRP8YHR165C 7242 nt2.61□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 BAS1YKR099W 2436 nt2.61□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 FLO11YIR019C 4104 nt2.61□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 PFF1YBR074W 2931 nt2.61□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 PAU14YIL176C 363 nt2.61□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 PAU1YJL223C 363 nt2.61□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 RAM2YKL019W 951 nt2.61□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 TMA10YLR327C 261 nt2.61□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt2.61□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 RPO41YFL036W 4056 nt2.61□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 IRC10YOL015W 1761 nt2.6□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 YDL152WYDL152W 366 nt2.6□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 YAR053WYAR053W 297 nt2.6□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 YAF9YNL107W 681 nt2.6□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 BIL1YOR304C-A 231 nt2.6□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 snR76snR76 109 nt2.59□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 snR79snR79 84 nt2.59□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 NHP2YDL208W 471 nt2.59□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.59□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 AAD16YFL057C 459 nt2.59□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 AYR1YIL124W 894 nt2.59□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 YLR458WYLR458W 381 nt2.59□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 YOR050CYOR050C 348 nt2.59□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 ASG1YIL130W 2895 nt2.59□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 SRB8YCR081W 4284 nt2.59□□□□□ -2
LCB4Q12246 YBT1YLL048C 4986 nt2.59□□□□□ -2
LCB4Q12246 DNL4YOR005C 2835 nt2.58□□□□□ -2
LCB4Q12246 YDR413CYDR413C 576 nt2.58□□□□□ -2
LCB4Q12246 YHL037CYHL037C 402 nt2.58□□□□□ -2
LCB4Q12246 MSL1YIR009W 336 nt2.58□□□□□ -2
LCB4Q12246 RPL20AYMR242C 519 nt2.58□□□□□ -2
LCB4Q12246 YBR197CYBR197C 654 nt2.58□□□□□ -2
LCB4Q12246 SAP1YER047C 2694 nt2.58□□□□□ -2
LCB4Q12246 MAM33YIL070C 801 nt2.57□□□□□ -2
LCB4Q12246 RGM1YMR182C 636 nt2.57□□□□□ -2
LCB4Q12246 RPL9BYNL067W 576 nt2.57□□□□□ -2
LCB4Q12246 CYR1YJL005W 6081 nt2.57□□□□□ -2
LCB4Q12246 SWT1YOR166C 1377 nt2.57□□□□□ -2
LCB4Q12246 SLH1YGR271W 5904 nt2.56□□□□□ -2
LCB4Q12246 RPL40AYIL148W 387 nt2.56□□□□□ -2
LCB4Q12246 YJL202CYJL202C 348 nt2.56□□□□□ -2
LCB4Q12246 FKS3YMR306W 5358 nt2.56□□□□□ -2
LCB4Q12246 FRE2YKL220C 2136 nt2.56□□□□□ -2
LCB4Q12246 PCF11YDR228C 1881 nt2.55□□□□□ -2
LCB4Q12246 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.55□□□□□ -2
LCB4Q12246 TMA22YJR014W 597 nt2.55□□□□□ -2
LCB4Q12246 RPS18BYML026C 441 nt2.55□□□□□ -2
LCB4Q12246 PGA1YNL158W 597 nt2.55□□□□□ -2
LCB4Q12246 ATP3YBR039W 936 nt2.55□□□□□ -2
LCB4Q12246 NAN1YPL126W 2691 nt2.55□□□□□ -2
LCB4Q12246 YPR146CYPR146C 330 nt2.55□□□□□ -2
LCB4Q12246 OSW7YFR039C 1533 nt2.54□□□□□ -2
LCB4Q12246 RSN1YMR266W 2862 nt2.54□□□□□ -2
LCB4Q12246 MZM1YDR493W 372 nt2.54□□□□□ -2
LCB4Q12246 TWF1YGR080W 999 nt2.54□□□□□ -2
LCB4Q12246 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.54□□□□□ -2
LCB4Q12246 YNL010WYNL010W 726 nt2.54□□□□□ -2
LCB4Q12246 TIM18YOR297C 579 nt2.54□□□□□ -2
LCB4Q12246 FMP23YBR047W 528 nt2.54□□□□□ -2
LCB4Q12246 CDC24YAL041W 2565 nt2.54□□□□□ -2
LCB4Q12246 YMR324CYMR324C 243 nt2.53□□□□□ -2
LCB4Q12246 IRC23YOR044W 474 nt2.53□□□□□ -2
LCB4Q12246 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt2.53□□□□□ -2
LCB4Q12246 LCL1YPL056C 306 nt2.53□□□□□ -2
LCB4Q12246 ROX1YPR065W 1107 nt2.53□□□□□ -2
LCB4Q12246 DUG2YBR281C 2637 nt2.53□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 PHO91YNR013C 2685 nt2.52□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 YCR022CYCR022C 345 nt2.52□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 YER097WYER097W 330 nt2.52□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 YFR056CYFR056C 369 nt2.52□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.52□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.52□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 KSP1YHR082C 3090 nt2.52□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 VTC3YPL019C 2508 nt2.51□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 YDR102CYDR102C 333 nt2.51□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 LSO2YGR169C-A 279 nt2.51□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 RPL26AYLR344W 384 nt2.51□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 YOR055WYOR055W 435 nt2.51□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 MSB1YOR188W 3414 nt2.51□□□□□ -2.01
LCB4Q12246 JSN1YJR091C 3276 nt2.51□□□□□ -2.01
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