Protein–RNA interactions for Protein: P42947

YJL107C, Uncharacterized UPF0442 protein YJL107C, yeastyeast

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL107CP42947 ARP8YOR141C 2646 nt2.59□□□□□ -1.99
YJL107CP42947 ESC1YMR219W 4977 nt2.59□□□□□ -2
YJL107CP42947 YJR003CYJR003C 1560 nt2.58□□□□□ -2
YJL107CP42947 NFT1YKR103W 3657 nt2.58□□□□□ -2
YJL107CP42947 YDL152WYDL152W 366 nt2.58□□□□□ -2
YJL107CP42947 TWF1YGR080W 999 nt2.58□□□□□ -2
YJL107CP42947 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.58□□□□□ -2
YJL107CP42947 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.58□□□□□ -2
YJL107CP42947 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.58□□□□□ -2
YJL107CP42947 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.58□□□□□ -2
YJL107CP42947 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.58□□□□□ -2
YJL107CP42947 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.58□□□□□ -2
YJL107CP42947 AIM32YML050W 936 nt2.58□□□□□ -2
YJL107CP42947 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt2.58□□□□□ -2
YJL107CP42947 SGS1YMR190C 4344 nt2.58□□□□□ -2
YJL107CP42947 MRD1YPR112C 2664 nt2.58□□□□□ -2
YJL107CP42947 PUF4YGL014W 2667 nt2.57□□□□□ -2
YJL107CP42947 COX1Q0045 1605 nt2.57□□□□□ -2
YJL107CP42947 NAB6YML117W 3405 nt2.57□□□□□ -2
YJL107CP42947 YHL037CYHL037C 402 nt2.57□□□□□ -2
YJL107CP42947 MAM33YIL070C 801 nt2.57□□□□□ -2
YJL107CP42947 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt2.57□□□□□ -2
YJL107CP42947 YPL238CYPL238C 390 nt2.57□□□□□ -2
YJL107CP42947 TPS2YDR074W 2691 nt2.57□□□□□ -2
YJL107CP42947 YIL166CYIL166C 1629 nt2.57□□□□□ -2
YJL107CP42947 YPK1YKL126W 2043 nt2.56□□□□□ -2
YJL107CP42947 GCV2YMR189W 3105 nt2.56□□□□□ -2
YJL107CP42947 YDR413CYDR413C 576 nt2.56□□□□□ -2
YJL107CP42947 NCE101YJL205C 162 nt2.56□□□□□ -2
YJL107CP42947 YOR055WYOR055W 435 nt2.56□□□□□ -2
YJL107CP42947 DNL4YOR005C 2835 nt2.56□□□□□ -2
YJL107CP42947 YJL016WYJL016W 1686 nt2.56□□□□□ -2
YJL107CP42947 YIL080WYIL080W 4722 nt2.55□□□□□ -2
YJL107CP42947 YCR022CYCR022C 345 nt2.55□□□□□ -2
YJL107CP42947 PTP3YER075C 2787 nt2.55□□□□□ -2
YJL107CP42947 YER189WYER189W 369 nt2.55□□□□□ -2
YJL107CP42947 HYR1YIR037W 492 nt2.55□□□□□ -2
YJL107CP42947 NUP82YJL061W 2142 nt2.55□□□□□ -2
YJL107CP42947 FPR1YNL135C 345 nt2.55□□□□□ -2
YJL107CP42947 BAS1YKR099W 2436 nt2.54□□□□□ -2
YJL107CP42947 SWT1YOR166C 1377 nt2.54□□□□□ -2
YJL107CP42947 ADK1YDR226W 669 nt2.54□□□□□ -2
YJL107CP42947 YAR053WYAR053W 297 nt2.54□□□□□ -2
YJL107CP42947 BRO1YPL084W 2535 nt2.54□□□□□ -2
YJL107CP42947 JSN1YJR091C 3276 nt2.54□□□□□ -2
YJL107CP42947 SSE1YPL106C 2082 nt2.54□□□□□ -2
YJL107CP42947 VPS52YDR484W 1926 nt2.54□□□□□ -2
YJL107CP42947 YER097WYER097W 330 nt2.53□□□□□ -2
YJL107CP42947 PAU14YIL176C 363 nt2.53□□□□□ -2
YJL107CP42947 PAU1YJL223C 363 nt2.53□□□□□ -2
YJL107CP42947 TIM18YOR297C 579 nt2.53□□□□□ -2
YJL107CP42947 BIL1YOR304C-A 231 nt2.53□□□□□ -2
YJL107CP42947 SKT5YBL061C 2091 nt2.53□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 YJL181WYJL181W 1836 nt2.52□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 NEW1YPL226W 3591 nt2.52□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 snR76snR76 109 nt2.52□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.52□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.52□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.52□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 MSL1YIR009W 336 nt2.52□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 MRPL33YMR286W 261 nt2.52□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 RPL25YOL127W 429 nt2.52□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 snR43snR43 209 nt2.52□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 MSS11YMR164C 2277 nt2.52□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 SDC25YLL016W 3147 nt2.51□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 YDL041WYDL041W 354 nt2.51□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 YDR209CYDR209C 414 nt2.51□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.51□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 YLR031WYLR031W 561 nt2.51□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 KTI11YBL071W-A 249 nt2.51□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 ROX1YPR065W 1107 nt2.51□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 STE11YLR362W 2154 nt2.51□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 ECM25YJL201W 1800 nt2.51□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 RGA2YDR379W 3030 nt2.51□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 RRP12YPL012W 3687 nt2.5□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 MLH1YMR167W 2310 nt2.5□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 YDR102CYDR102C 333 nt2.5□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.5□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 YJL202CYJL202C 348 nt2.5□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 RGM1YMR182C 636 nt2.5□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 YOR050CYOR050C 348 nt2.5□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 ATP3YBR039W 936 nt2.5□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 TRM7YBR061C 933 nt2.5□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 RLI1YDR091C 1827 nt2.49□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 VPS13YLL040C 9435 nt2.49□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 PSO2YMR137C 1986 nt2.49□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 snR79snR79 84 nt2.49□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 VPS41YDR080W 2979 nt2.49□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 SDC1YDR469W 528 nt2.49□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 CAJ1YER048C 1176 nt2.49□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 EMC6YLL014W 327 nt2.49□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 CCW14YLR390W-A 717 nt2.49□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 RPL9BYNL067W 576 nt2.49□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.49□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 MGR1YCL044C 1254 nt2.49□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 IRC10YOL015W 1761 nt2.49□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 SVL3YPL032C 2478 nt2.48□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 PCF11YDR228C 1881 nt2.48□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 ISW1YBR245C 3390 nt2.48□□□□□ -2.01
YJL107CP42947 YFL032WYFL032W 321 nt2.48□□□□□ -2.01
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