Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF4Q2M2E3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms